点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章档次,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU...
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将转录组测序数据上传到GEO(Gene Expression Omnibus)数据库的步骤如下: 注册GEO账号:在上传数据之前,你需要在GEO数据库上注册一个账号。可以通过访问GEO网站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)并点击“Register”按钮来完成。 创建一个GEO系列:在登录GEO账号
宏基因组学:16s测序、宏全基因组测序数据。 2. 基于公共数据库的高级分析: 基于TCGA/GEO/SRA/EBI数据库做癌症靶标预测(miRNA,lncRNA, mRNA)和通路功能筛选。 多套数据整合分析. 3. 多组学整合分析(基于标准分析结果,添加高级分析): 全转录组整合分析; ...
16S rRNA基因V5V6区扩增子测序 + GeoChip 5.0芯片检测 样品采集:样本采集自Los Nevados国家自然公园，El Coquito温泉，三株相距10 m以内的Espeletia hartwegiana（如图）。叶（50-100 g）分三个层次，共两组用于内生菌和附生微生物研究：上层：嫩叶；中层：充分发育的成熟叶片；下层：老叶或坏死部分。根（1-5 ...
GeoChip助力中科院在地学类一级期刊发佳作！中国科学院深海科学与工程研究所课题组在地学类一级期刊《Geochimica et Cosmochimica Acta》发文！该研究利用16s rRNA扩增子测序和GeoChip 5.0芯片技术，探讨了碳酸盐矿床的形成过程中微生物发挥的重要作用。主导冲绳海槽沉积柱内自生碳酸盐岩形成的生物地理化学过程 Biogeochemi...
关键基因的丰度赋予超高温堆肥优异的性能Abundances of keystone genes confer superior performance in hyperthermophilic composting作者：Peng Cui等期刊：Journal of Cleaner Production发表时间：2021.11.08影响因子：9.297组学策略：GeoChip、16S合作单位：福建农林大学DOI：10.1016/J.JCLEPRO.2021.129589文章摘要人类...
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5.微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6.生物信息入门到精通必修基础课,学习链接:linux系统使用、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图 7.医学相关数据挖掘课程,不用做实验也能发文章,学习链接:TCGA-差异基因分析、GEO芯片数据挖掘、GSEA富集分析课程、TCGA临床数据生存...