GEO是生信分析经常用到的数据库。经常需要从中获取 表达矩阵,平台信息,meta信息等。本次介绍一种较为常用和成功率高的下载方法。在R语言中处理多个探针对应一个表达值,无对应symbol,以及合并多个探针对应一个 …
如果需要下载额外的临床信息数据，可以通过编写特定的R代码实现数据的保存。最终，所获取的表达矩阵文件与临床信息数据都被保存在R环境设定的目录中，整个从GEO数据库下载并整理至表达矩阵的过程至此完成。