C:\Users\dongl\AppData\Local\Temp\RtmpchgBFq/GSE87023_series_matrix.txt.gz 那如果重试还是下载失败,就手动去官方下载该文件吧。 检索数据 发现文件 下载 下载完成之后,给出文件的全路径,即可顺利录入到R中。 gset<-getGEO(filename="path/GSE87023_series_matrix.txt.g...
这样就把表达矩阵下载下来了,但是注释信息还得想想办法。如果还是从getGEO这个函数下载的话好像不太靠谱。虽然印象里也可以下载GPL文件。 不过这次没有用getGEO,而是直接去GEO官网找到了GPL6884平台的注释文件。 下载下来是一个25M的txt文件,记事本卡死了好几次。所以把txt拖到Chrome里面看了一下,前面几行是#开头的...
#从GitHub安装geoviz包devtools::install_github("your_github_username/geoviz") 1. 2. 请将your_github_username替换成实际的用户名,确保“geoviz”包确实存在于指定位置。 总结 通过以上步骤,你应该能够顺利解决在R中下载“geoviz”包失败的问题。记得每一步仔细检查,尤其是网络连接和依赖包的安装情况。如果还有...
方法二(推荐):在pom.xml中加入osgeo的仓库地址(注意setting中阿里云镜像的参数应为<mirrorOf>central</mirrorOf>): <repositories><repository><id>osgeo</id><name>OSGeo Release Repository</name><url>https://repo.osgeo.org/repository/release/</url><snapshots><enabled>false</enabled></snapshots><relea...
其实不仅仅是在加载Bioconductor包的时候会有这样的连不上的报错,在下载有些数据的时候也会,比如下载GEO的数据: >library(GEOquery) Setting options('download.file.method.GEOquery'='auto') Setting options('GEOquery.inmemory.gpl'=FALSE)>if(!file.exists(f)){} ...
1回复贴,共1页 <<返回geogebra吧为什么官网下载下得超级慢,每秒十几KB,而且最后还下载失败? 只看楼主 收藏 回复 还是我 默默无闻 1 Wyl2204 默默无闻 1 有没有想法一起拼购ggb课件?登录百度帐号 下次自动登录 忘记密码? 扫二维码下载贴吧客户端 下载贴吧APP看高清直播、视频! 贴吧页面意见反馈 违规贴吧...
C:\Users\dongl\AppData\Local\Temp\RtmpchgBFq/GSE87023_series_matrix.txt.gz 那如果重试还是下载失败,就手动去官方下载该文件吧。 检索数据 发现文件 下载 下载完成之后,给出文件的全路径,即可顺利录入到R中。 gset<-getGEO(filename="path/GSE87023_series_matrix.txt.g...
但是阿里的镜像中并没有关于GeoTools的依赖,在此不去探究没有此依赖的原因。 现记录一下我是如何解决此问题的: 方法一:直接去官网下载,然后引入依赖 方法二:在Maven的settings.xml中阿里镜像同级位置添加osgeo仓库地址,(osgeo-snapshot、GeoSolutions也可参考下面的方法) ...
C:\Users\dongl\AppData\Local\Temp\RtmpchgBFq/GSE87023_series_matrix.txt.gz 那如果重试还是下载失败,就手动去官方下载该文件吧。 检索数据 发现文件 下载 下载完成之后,给出文件的全路径,即可顺利录入到R中。 gset<-getGEO(filename="path/GSE87023_series_matrix.txt.g...