GeneSwitches首先通过对分化轨迹中的基因进行二值化分析,筛选出了表达特性上存在on和off两个状态的潜在开关基因。随后软件对这些潜在开关基因进行逻辑回归分析和McFadden’s Pseudo R2拟时间相关性分析:通过逻辑回归分析推算出每个开关基因的开关时间(Switching Time Point);通过拟时间相关性分析得到每个相关性R2值,其中表达...