Gene Ontology中最基本的概念是term。GO里面的每一个entry都有一个唯一的数字标记,形如GO:nnnnnnn,还有一个term名,比如"cell", "fibroblast growth factor receptor binding",或者"signal transduction"。每个term都属于一个ontology,总共有三个ontology,它们分别是molecular function, cellular component和biological proce...
每个term都属于一个ontology,总共有三个ontology,它们分别是molecular function, cellular component和biological process。 一个基因product可能会出现在不止一个cellular component里面,也可能会在很多biological process里面起作用,并且在其中发挥不同的molecular function。比如,基因product "cytochrome c" 用molecular ...
会员中心 VIP福利社 VIP免费专区 VIP专属特权 客户端 登录 百度文库 期刊文献 图书gene ontology (go) term enrichment analysisgene ontology (go) term enrichment analysis:基因本体论术语富集分析 ©2022 Baidu |由 百度智能云 提供计算服务 | 使用百度前必读 | 文库协议 | 网站地图 | 百度营销 ...
GO annotationsare evidence-based statements relating a specific gene product (a protein, non-codingRNA, or macromolecular complex, which we referred as ‘genes’ for simplicity) to a specific ontology term. 3. Toolsthat facilitate the creation, maintenance and use of ontologies. Software being deve...
Gene Ontology中最基本的概念是 term 。 GO里面的每一个entry都有一个唯一的数字标记,形如 GO: nnnnnnn,还有一个term名,比如 "cell", "fibroblast growth factor receptor binding",或者 "signal transduction"。 每个term都属于一个ontology,总共有三个ontology,它们分别是molecular function, cellular component和bi...
经过比较发现 eggNOG 的GO注释结果存在较多的 废弃的term (obsolete term ),interpro 的结果更新,相对来说默认参数注释结果interpro 比eggNOG 注释结果比例更高(推荐使用interpro )。 3.结果解析 使用一个python解析interpro 或eggNOG或者其他来源的wego格式的GO结果 依赖: python3 goatools (pip install goatools ...
基因本体论(Gene Ontology)基本介绍 内部资料仅供参考 基因本体论 (Gene Ontology)数据库基本介绍Version No.2010.10.03 西安电子科技大学计算机学院 作者：孔垂亮 电邮：morrain1987@foxmail.com 导师：高琳
GO, Gene Ontology 基因本体库,分为MF、CC、BP三类。可使用GO.db包获取数据; DO,Disease Ontology 疾病本体库;与GO一样也是directed acyclic graph结构。 (2)Term 两两相似度分析方法 Information content-based methods:Resnik method、Lin method、Rel method、Jiang method ...
One such reference is the Gene Ontology (GO). A number of groups have suggested that the semantic similarity of the GO annotations of genes can serve as a proxy for functional relatedness. Here we evaluate a simple measure of semantic similarity, term overlap (TO). Results We computed the ...
Ontologyisaterm borrowed from philosophy that refers to the science of describing the kinds of entities in the world and how they are related. fao.org fao.org 本体借用哲学词汇,是归属于描述世界上实体类别及其它们之间如何联系的科学。 fao.org ...