Gene Ontology (GO)项目正是为了能够使对各种数据库中基因产物功能描述相一致的努力结果。这个项目最初是由1988年对三个模式生物数据库的整合开始:: FlyBase (果蝇数据库Drosophila),t Saccharomyces Genome Database (酵母基因组数据库SGD) and the Mouse Genome Database (小鼠基因组数据库MGD)。从那开始,GO不...
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其实我们在文献中经常可以看到GO analysis和KEGG Pathway相关的图,只是之前没太留意。如图1和图2所示,通过观察,我们可以发现两幅图的共性:纵坐标显示为不同的通路或者生物功能,横坐标为-log10(FDR)或-log10(p-value)。其中FDR全称为False discovery rate,反映的是检验中假阳性率的概率。简单来说,FDR就是利用某种...
基因注释（Gene Ontology，简称GO）是一个标准化、结构化的术语系统，用于描述基因和基因产物的功能。GO旨在统一生物信息学领域中基因功能的描述，以提高数据检索的一致性和效率。通过整合多个生物信息学数据库，GO为研究者提供了一个通用的框架，用于理解基因在分子功能、生物学途径和细胞组件等不同层次上的...
Gene Ontology(简称GO)是基因功能国际标准分类体系。GO可分为分子功能(Molecular Function),生物过程(biological process)和细胞组成(cellular component)三个部分。GO-Analysis对差异基因等按GO分类,并对分类结果进行基于离散分布的显著性分析、误判率分析、富集度分析,得出与实验目的有显著联系的、低误判率的、靶向性的...
Gene Ontology(GO)分析 Gene Ontology 可分为分子功能(Molecular Function ),生物过程(biological process )和细胞 组成(cellular component )三个部分。蛋白质或者基因可以通过ID 对应或者序列注释的方 法找到与之对应的GO 号,而GO 号可对于到Term,即功能类别或者细胞定位。 参考网站: 功能富集分析 功能富集需要有...
在上期内容中，小桦同学通过DAVID数据库分析得到的基因差异富集结果如何转化为直观的图像展示？答案就是将这些结果转化为柱状图或横置柱图。本文将指导你如何在Excel和GraphPad中实现这一过程。首先，导入DAVID数据库的文本结果到Excel，选择GO Term和p-value列（如图3所示）。计算-log10(p-value)值，然后...
Gene Ontology(GO) project主要是由The Gene Ontology Consortium所負責,從1998年開展自今,其重點就是將基因做系統性地注釋,不再只用gene的序列來描述,是用更豐富多元的方式來描述基因的性質,且由此計畫發展出許多針對特定物種的資料庫,簡單說,Gene Ontology的基因注釋分類,提供一套能系統性分析基因功能的工具。將每個...
百度试题 结果1 题目基因本体(gene ontology,GO) 相关知识点: 试题来源: 解析 GO数据库是GO组织构建的一个结构化的标准生物模型,旨在建立基因及其产物知识的标准词汇体系,目前已经成为应用最广泛的基因注释体系之一。反馈 收藏