一个ontology会被一个控制字集来描述并给予一定的名称,通过制定“本体”ontologies并运用统计学方法及自然语言处理技术,可以实现知识管理的专家系统控制。 到目前为止,Gene Ontology Consortium(GO的发起组织)的数据库中有3大独立的ontology被建立起来:biological process生物过程, molecular function分子功能及cellular compone...
為Gene Ontology Consortium官方支持的網頁工具,由NHGRI-NIH所贊助,所以會根據NHGRI-NIH所補助的方向來發展,在網頁裡可以直接query, browse, visualizing GO的資料和從MOD, UniProtKB及其他地方搜集而來的annotation,詳細的來源可以參考,具有wizard interface,最近已大幅度提升運行速度,增加許多其他的資料型態可供使用如displa...
(2000). Gene ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium. Nature genetics, 25(1), 25–29. doi.org/10.1038/75556Yu G, Wang L, Han Y and He Q*. clusterProfiler: an R package for comparing biological themes among gene clusters. OMICS: A Journal of ...
到目 前为止,Gene Ontology Consortium(GO的发起组织)的数据库中有3大独立的ontology被建立起来:biological process生物过程, molecular function分子功能及cellular component细胞组分。而这三个ontology下面又可以独立出不同的亚层次,层层向下构成一个ontologies的树型分支结构。可以说, GO是生物学的统一化工具。
到目前为止,Gene Ontology Consortium(GO的发起组织)的数据库中有3大独立的ontology被建立起来:biological process生物过程, molecular function分子功能及cellular component细胞组分。而这三个ontology下面又可以独立出不同的亚层次,层层向下构成一个ontologies的树型分支结构。可以说, GO是生物学的统一化工具。
(Gene Ontology)概览2为什么要建立Gene Ontology 解决生物学定义混乱的现象,使各种数据库中基因产物功能描述相一致 使得在不同生物数据库中的查询具有极高的一致性 允许在各种水平查询基因产物的特性3Gene Ontology widely adopted AgBase4GO(gene ontology)是: 基因本体联合会(Gene Onotology Consortium)所建立的数据库...
Gene Ontology Consortium: going forward The Gene Ontology (GO; http://www.geneontology.org) is a community-based bioinformatics resource that supplies information about gene product function using ontologies to represent biological knowledge. Here we describe improvements and ... JA Blake,J Chan,R ...
Gene Ontology Consortium. The Gene Ontology (GO) database and informatics resource. Nucleic Acids Res 2004; 32:D258-D261.Harris, M.A. et al. Gene Ontology Consortium. The Gene Ontology (GO) database and informatics resource. Nucleic Acids Res. 2004, 32 (Database issue): D258- 261...
of information on the functions of genes. This knowledge is both human-readable and machine-readable, and is a foundation for computational analysis of large-scale molecular biology and genetics experiments in biomedical research. For more information, please see our website,http://geneontology.org...