这个分类包括了472个包含了表达产物参与特定的代谢和信号通路的基因,如8个人工精选的公开可用的数据库以及50个为了响应遗传和化学扰动而共同调控并被各种实验论文所报道的基因。 调控motif(C3,57个基因集) 这个分类是基于我们最近工作报道的57个在人类基因的启动子区常见的保守调控motif^[11]^,并使得能够将微阵列实验...
iRegulon插件使用一组共调控基因中的motif和track发现来识别调节子。归一化富集评分(NES)越高,TF越可靠。 结果 核编码的线粒体基因在HCM中显著变化 在差异表达分析中,共获得了2927个差异表达基因(DEG),其中1499个上调,其余1428个下调(图1A)。为了探索NMGene在HCM中的表达模式,从MitoCarta、MitoMiner、IMPI和UniProt...
(1)整体把握m6A甲基化图谱特征:m6A peak数量变化、m6A修饰基因数量变化、单个基因m6A peak数量分析、m6A peak在基因元件上的分布、m6A peak的motif分析、m6A peak修饰基因的功能分析 (2)筛选具体差异m6A peak和基因:差异m6A peak鉴定、非时序数据的分析策略、时序数据的分析策略、差异m6A修饰基因的功能分析、差异m6A修...