GEO全称Gene Expression Omnibus data base,由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库(通过NCBI首页,All Databases下拉框中选择GEO DataSets)。收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据。2000年开始建立的时候,主要是表达芯片数据(如其名),但是之后随着数据库的流行,逐渐扩展业务到许多其它的高通量...
GEO(Gene Expression Omnibus)数据库由美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)建立。该数据库存储了全球范围内科研工作者上传的高通量数据的初步分析结果,包括微阵列芯片、转录组二代测序表达量文件,甲基化结果文件等。GEO的结果文件可以免费下载,是进行数据挖掘的理想数据库。本文中,...
GEO全称Gene Expression Omnibus data base,由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库(通过NCBI首页,All Databases下拉框中选择GEO DataSets)。收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据。2000年开始建立的时候,主要是表达芯片数据(如其名),但是之后随着数据库的流行,逐渐扩展业务到许多其它的高通量...
GEO，全称为Gene Expression Omnibus data base，由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。该数据库收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，包括但不限于表达芯片数据、甲基化数据、染色质结构数据和基因组-蛋白交互作用数据。GEO数据库的记录方式不仅包括原始数据、处理过的数据和...
关键是这个数据是免费的! NCBI Gene Expression Omnibus(GEO)作为各种高通量实验数据的公共存储库。这些数据包括基于单通道和双通道微阵列的实验,检测mRNA,基因组DNA和蛋白质丰度,以及非阵列技术,如基因表达系列分析(SAGE),质谱蛋白质组学数据和高通量测序数据。 在GEO最基本的组织层面,有四种基本实体类型。前三个(...
geo高通量基因表达omnibusgene数据库 ISSN1007-7626 CN11-3870PQ 中国生物化学与分子生物学报 ChineseJournalofBiochemistryandMolecularBiology 2007年3月 23(3):236~244 #技术与方法# GEO(GeneExpressionOmnibus):高通量基因表达数据库 刘华 * ,马文丽,郑文岭 (南方医科大学基因工程研究所,广州510515) 摘要GEO(Gene...
GeneExpressionOmnibus(GEO)/ Microarraysingeneexpression Atypicalgeneexpressionanalysisexperiment:1.Differentialsystems–e.g.cancervs.normal,drugvs.nodrug 2.Choose/preparethemicroarray3.ExtracttotalmRNA(transcriptome)4.Reversetranscription/dyelabeling5.Combineequalamounts6.Hybridize7.Scan8.ANALYSEANDINTERPRETTHE...
GEO Gene Expression Omnibus GEO Gene Expression Omnibus 基因表达数据库 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ GEO的数据存储方式 GEO数据库具体存放四类数据:GSE、GDS、GSM、GPL GEO Series Study GSE号(GSExxx)对应的是整个研究项目的系列的数据,可能会涉及不同平台。
biology2007 年 3 月23 (3) :236244·技术与方法·expression omnibus ) :高通量基因表达数据库geo( gene3刘华,马文丽 ,郑文岭( 南方医科大学基因工程研究所 ,广州 510515)摘要 geo ( gene expression omnibus) 数据库包括高通量实验数据的广泛分类 ,有单通道和双通道以微阵列为基础的对 mrna 丰度的测定 ; ...
GEO数据库,全称GENE EXPRESSION OMNIBUS,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据,即只要是目前已经发表的论文,论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以通过这个数据库中找到,而且该数据库是免费的。