答:blastn是将给定的核酸序列与核酸数据库中的序列进行比较;Blastp是使用蛋白质序列与蛋白质数据库中的序列进行比较,可以寻找较远的关系;Blastx将给定的核酸序列按照六种阅读框架将其翻译成蛋白质与蛋白质数据库中的序列进行比对,对分析新序列和EST很有用;Tblastn将给定的氨基酸序列与核酸数据库中的序列(双链)按不...
把你的序列核酸（氨基酸）序列，用BLAST的方法搜索，如果是核酸序列就用BLAST n ，氨基酸序列就用BLAST p，比对后与你输入的序列相似性为100%的就是你要找的序列，同时也有你要的序列号。具体操作：在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面，选择BLAST n或BLAST p，输入你的序列，点BLAST，找...
GenBank BLASTn results of trnH-psbA and rbcL-a as a barcode tested singly and as a pair.W., John KressDavid, L. Erickson
内容提示: GenBank比对结果Format !粘贴序列BLASTBLASTnBLAST ! 图 3-12 在 GenBank 数据库中进行 DNA 序列 BLAST 的流程 文档格式:PDF | 页数:2 | 浏览次数:142 | 上传日期:2013-04-15 12:59:24 | 文档星级: GenBank比对结果Format !粘贴序列BLASTBLASTnBLAST ! 图 3-12 在 GenBank 数据库中进行 ...
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GenBank数据库检索及其应用2019 GenBank数据库检索及其应用——Entrez检索功能 重庆医科大学图书馆李轶 NCBI网站简介ncbi.nlm.nih.gov NCBI的资源与工具 数据库工具 数据提交 培训 NCBI的资源与工具 数据库 NCBI的资源与工具 文献数据库分子数据库 基因组数据库 NCBI的资源与工具 工具 NCBI的资源与工具 检索工具 数据...
Boratyn GM, Camacho C, Cooper PS, Coulouris G, Fong A, Ma N, Madden TL, Matten WT, McGinnis SD, Merezhuk Y et al (2013) BLAST: a more efficient report with usability improvements. Nucleic Acids Res 41:W29–W33 Article PubMed Central PubMed Google Scholar Altschul SF, Gish W, Mi...
BLAST是“局部相似性基本查询工具”(Basic Local Alignment Search Tool)的缩写,包括一系列查询程序(见表1),是十分方便及强大的查询工具。用户可通过e-mail得到BLAST的文件及帮助,地址为:blast-help @ ncbi.nlm.nih.gov。 表1. BLAST系列程序 程序 待查序列 数据库 序列 评价 举例 BLASTN 核酸(双链) 核酸 1...
BLASTN 核酸(双链) 核酸 1.优化参数提高速度,不敏感 2.不针对相关性较远的编码 区 3.自动检查待查序列的互补 链 1,4 BLASTX 核酸 6个翻译读框 蛋白 1.对于有潜在移码错误的初 步序列十分适用,如EST及 其它“单一通过”序列 2.适用于14种不同遗传...
PSI-BLAST|PHI-BLAST|UniProt|IGV|Galaxy|clustalx 2019-12-25 15:29 − 生物信息学软件: NCBI:BLAST,设定k-mer 默认是全局比对,Blastn是局部比对。 PSI-BLAST最灵敏的BLAST,选中部分矩阵后在数据库中查找相应蛋白。 PHI-BLAST找氨基酸motif ,参数有-db 数据库,-query 输入文件,-cut输出文件 Ensembl模式生...