具体操作：在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面，选择BLAST n或BLAST p，输入你的序列，点BLAST，找出与你的序列100%相似的，（一般是第一个或前几个），看图的下面具体详细信息，OK。以大肠杆菌的质粒pO26-S1为例：登陆NCBI的主页http://www.ncbi.nlm.nih.gov，在”search”中选择”Ge...
答:blastn是将给定的核酸序列与核酸数据库中的序列进行比较;Blastp是使用蛋白质序列与蛋白质数据库中的序列进行比较,可以寻找较远的关系;Blastx将给定的核酸序列按照六种阅读框架将其翻译成蛋白质与蛋白质数据库中的序列进行比对,对分析新序列和EST很有用;Tblastn将给定的氨基酸序列与核酸数据库中的序列(双链)按不...
内容提示: GenBank比对结果Format !粘贴序列BLASTBLASTnBLAST ! 图 3-12 在 GenBank 数据库中进行 DNA 序列 BLAST 的流程 文档格式:PDF | 页数:2 | 浏览次数:147 | 上传日期:2013-04-15 12:59:24 | 文档星级: GenBank比对结果Format !粘贴序列BLASTBLASTnBLAST ! 图 3-12 在 GenBank 数据库中进行 ...
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BLAST: a more efficient report with usability improvements. Nucleic Acids Res. 2013; 41: W29– W33. Google Scholar Crossref PubMed WorldCat 9. O’Leary N.A., Cox E., Holmes J.B., Anderson W.R., Falk R., Hem V., Tsuchiya M.T.N., Schuler G.D., Zhang X., ...
BLASTN 核酸(双链) 核酸 1.优化参数提高速度,不敏感 2.不针对相关性较远的编码 区 3.自动检查待查序列的互补 链 1,4 BLASTX 核酸 6个翻译读框 蛋白 1.对于有潜在移码错误的初 步序列十分适用,如EST及 其它“单一通过”序列 2.适用于14种不同遗传...
GenBank BLASTn results of trnH-psbA and rbcL-a as a barcode tested singly and as a pair.W., John KressDavid, L. Erickson
BLAST是“局部相似性基本查询工具”(Basic Local Alignment Search Tool)的缩写,包括一系列查询程序(见表1),是十分方便及强大的查询工具。用户可通过e-mail得到BLAST的文件及帮助,地址为:blast-help @ ncbi.nlm.nih.gov。 表1. BLAST系列程序 程序 待查序列 数据库 序列 评价 举例 BLASTN 核酸(双链) 核酸 1...
用accession number,作者姓名,物种,基因/蛋白名字,还有许多其他的文本术语来查询。关于Entrez更多的信息请看下文。用BLAST来在GenBank和其他数据库中进行序列相似搜索。用E-mail来访问Entrez和BLAST可以通过Query和BLAST服务器。另外一种选择是可以用FTP下载整个的GenBank和更新数据。
as well as the biomedical journal literature in PubMed. BLAST provides sequence similarity searches of GenBank and other sequence databases. Complete bimonthly releases and daily updates of the GenBank database are available by FTP. GenBank usage scenarios ranging from local analyses of the data ...