BLAST是Basic Local Alignment Search Tool的英文缩写,意即碱基局部对准检索工具,是一种序列类似性检索工具。它采用统计学记分系统,能将真正配对的序列同随机产生的干扰序列区别开来;同时采用启发式算法系统,即采用的是局部对准算法(Local Alignment Algorithm),而不是全序列对准算法(Global Alignment Algorithm)。全序列对...
BLAST是Basic Local Alignment Search Tool的英文缩写,意即碱基局部对准检索工具,是一种序列类似性检索工具。它采用统计学记分系统,能将真正配对的序列同随机产生的干扰序列区别开来;同时采用启发式算法系统,即采用的是局部对准算法(Local Alignment Algorithm),而不是全序列对准算法(Global Alignment Algorithm)。全序列对...
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool):用于序列相似性搜索的工具。 ORFFinder:开放阅读框寻找器。 Sequin:用于序列数据提交的工具。 BankIt:基于Web的提交工具。 3.2 UCSC Genome Browser 由加州大学圣克鲁斯分校(UCSC)开发和维护的一个强大的基因组学工具,它提供了包括人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图 ...
把你的序列核酸（氨基酸）序列，用BLAST的方法搜索，如果是核酸序列就用BLAST n ，氨基酸序列就用BLAST p，比对后与你输入的序列相似性为100%的就是你要找的序列，同时也有你要的序列号。具体操作：在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面，选择BLAST n或BLAST p，输入你的序列，点BLAST，...
Learn how to access information stored in the GenBank database through the Geneious interface, including downloading nucleotide sequences, taxonomic information and publications, and running simple BLAST searches.
9 RegisterLog in Sign up with one click: Facebook Twitter Google Share on Facebook GenBank Acronyms Wikipedia Molecular biology An electronic repository of publicly available DNA sequences, which is maintained by the NIH. Cf Swiss-Prot.
3. FASTA格式 — 定义行号后只跟随序列数据(示例),参见描述数据库的readme文件,包括nt.Z(每天更新的非冗余BLAST核酸数据库,包括GenBank+EMBL+DDBJ+PDB序列,但是不包括EST, STS, GSS, or HTGS序列),nr.Z(每日更新的非冗余蛋白质),est.Z, gss.Z, htg.Z, sts.Z,和其它文件。
search engine is called Entrez, where users can locate information using sequence accession numbers (IDs) and key words. The default sequence alignment algorithm is BLAST, an algorithm combining heuristic seed search and dynamic program for alignment extension. NCBI also offers several valuable tools ...
• 访问GenBank - 通过Entrez Nucleotides来查询。用accession number，作者姓名，物种，基因/蛋白名字，还有许多其他的文本术语来查询。关于Entrez更多的信息请看下文。用BLAST来在GenBank和其他数据库中进行序列相似搜索。用E-mail来访问Entrez和BLAST可以通过Query和BLAST服务器。另 外一种选择是可以用FTP下载整个的...