从NCBI 数据库下载基因组数据时,部分样本会有genbank版本的基因组和refseq版本的基因组,两者有什么区呢? GenBank genome accession 以 GCA_ 起始 注释信息可有可无 第一次提交版本默认为1,后续作者提交更新版本,会在末尾加版本号 .2 A GenBank (GCA) genome assembly contains assembled genome sequences submit...
Accession prefix Molecule typeComment AC_ Genomic Complete genomic molecule, alternate assembly NC_ Genomic Complete genomic molecule, reference assembly NG_ Genomic Incomplete genomic region NT_ Genomic Contig or scaffold, clone-based or WGSa NW_ Genomic Contig or scaffold, primarily WGSa NS_ Genomic...
Accession prefix Molecule type Comment AC_ Genomic Complete genomic molecule, alternate assembly NC_ Genomic Complete genomic molecule, reference assembly NG_ Genomic Incomplete genomic region NT_ Genomic Contig or scaffold, clone-based or WGSa NW_ Genomic Contig or scaffold, primarily WGSa NS_ Genom...
来是重复的,但 RefSeq 和 GenBank 是分开的数据库,而且两者都是 可以通过在 Entrez nucleotide 中输入各自的 ACCESSION 获得。开始 时临时的 RefSeq 记录与 GenBank 记录非常相似。但是,当 RefSeq 记录被专家 review 以后,新增的序列数据、生物学注解、和参考文献 常被加入。那时,RefSeq 条目(即序列)代表一个来自...
如何在genbank中查找一基因的序列1、在GeneBank中查找基因序列只要输入accession号就可以了,下面网址就是一个基因的全部序列信息的例子,http://.ncbi.nlm.nih.gov/Sitemap/samplerecord.html,在记录的末尾有各种记录的详细说明,如果你没有accession号,可以把你手头的编号用source等信息源转换成accession号,中文教程太古...
如何在genbank中查找一基因的序列1在GeneBank中查找基因序列只要输入accession号就可以了,下面网址就是一个基因的全部序列信息的例子,在记录的末尾有各种记录的详细说明,如果你没有accession号
Accession prefix Molecule type Comment AC_ Genomic Complete genomic molecule, alternate assembly NC_ Genomic Complete genomic molecule, reference assembly NG_ Genomic Incomplete genomic region NT_ Genomic Contig or scaffold, clone-based or WGSa NW_ Genomic Contig or scaffold, primarily WGSa NS_ Genom...
3、没有收录,那就只有在 Nucleotide 数据库里找了,但是还是建议采用 Refseq 的序列, Refseq 序列特征如下:Accession prefix Molecule type CommentAC_ Genomic Complete genomic molecule, alternate assemblyNC_ Genomic Complete genomic molecule, reference assemblyNG_ Genomic Incomplete genomic regionNT_ Genomic Conti...
Accession prefix Molecule type Comment AC_ Genomic Complete genomic molecule, alternate assembly NC_ Genomic Complete genomic molecule, reference assembly NG_ Genomic Incomplete genomic region NT_ Genomic Contig or scaffold, clone-based or WGSa NW_ Genomic Contig or scaffold, primarily WGSa NS_ Genom...
Accession prefix Molecule type Comment AC_ Genomic Complete genomic molecule, alternate assembly NC_ Genomic Complete genomic molecule, reference assembly NG_ Genomic Incomplete genomic region NT_ Genomic Contig or scaffold, clone-based or WGSa NW_ Genomic Contig or scaffold, primarily WGSa NS_ Genom...