同时,利用GC-MS平台对志愿者血清样本进行代谢组广筛,得到了148种代谢产物,其中确定结构的有13种,包括谷氨酸、苯丙氨酸和酪氨酸,之后用靶向氨基酸检测进行验证。接着,用宏基因组得出来的结论与代谢组检测结果进行关联分析,发现肥胖人群中谷氨酸的含量非常高,与苗条人群的差异也最大,且在肥胖人群中,谷氨酸含量与多形拟...
非靶向代谢组学(Untargeted Metabolomics)主要是利用色谱-质谱联用技术,结合自建数据库或公共数据库对样本中代谢物进行搜库定性和相对定量的代谢组学方法,具有高通量、广覆盖的特点。主要研究思路针对对照组和处理组中检测到的代谢物通过单维和多维统计方法筛选出差异代谢物,再进行代谢通路分析进而阐明机体的作用机制,或筛...
因此,接下来使用多组学分析(代谢组学和转录组学)表征了AgNPs触发的种子分子变化。 首先,使用基于GC-MS非靶向代谢组学测定AgNPs或水干预24 h的水稻种子中代谢物。如图3A所示,OPLS-DA评分图表明两组之间有明显的分离。这表明AgNPs-启动在启动24小时内显著改变了水稻种子的代谢物谱。换句话说,AgNPs引发导致水稻种子中...
作者利用GC-MS非靶向代谢组学的结果,不仅找到与渗透度和总抗氧化剂容量相关的两个代谢物,还找到了与之密切相关的差异基因群,而且合理解释了耐旱性不同的两种水稻的分子机制差异,该研究的实验设计和研究思路都很清晰,可作为农业方向研究人员的参考。 猜你还想看 ◆代谢组学:项目文章 | 靶向代谢组学助力华东师范大...
GC-MS非靶向代谢组学代谢组学是研究生物体内所有代谢物变化规律和功能的科学,代谢组学研究一方面可以发掘一些新的分子标志物,另一方面通过与蛋白质组学、基因组学数据的联合分析,可以从原因和结果两方面分析生物体的内在变化,将系统生物学的研究推向更高水平。气相色谱质谱联用(GC-MS)是较为成熟的色谱-质谱联用技术...
1.GC-MS和LC-MS分析幼虫的生物活性研究 通过GC-MS非靶向代谢组学和LC-MS非靶向代谢组学分析代谢物谱发现，如图1a所示，就发育持续时间而言，实验（Tr）组的9.59±0.27天显着长于对照组（CK）组的8.23±0.11天（P <0.01）。如图1b所示，就生存率而言，Tr组的19.78±1.5％显着低于CK组的88.56±1...
stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学等研究方法,发现包括糖酵解/糖异生、磷酸戊糖代谢、嘌呤代谢、谷胱甘肽代谢、胺素代谢,丙氨酸和天冬氨酸等代谢途径被...
非靶向代谢组学GC-MS GC-MS系统中经气相色谱柱分离后的样品呈气态,流动相也是气体,与质谱的进样要求相匹配,最容易将这两种仪器联用,因此GC-MS技术也较为成熟。它具有灵敏度高、分离效率好、耐用、成本低、可选择性地分离和检测高通量的痕量代谢物质和同质异构体等优点,其高标准化地应用了电子电离(EI),能产生...
首先,使用基于GC-MS非靶向代谢组学测定AgNPs或水干预24 h的水稻种子中代谢物。如图3A所示,OPLS-DA评分图表明两组之间有明显的分离。这表明AgNPs-启动在启动24小时内显著改变了水稻种子的代谢物谱。换句话说,AgNPs引发导致水稻种子中的代谢重编程。 AgNPs增加了参与应激信号转导的几种代谢物的水平。例如,水杨酸(SA)...
基于GC-MS的非靶向代谢组学以及常用的数据库(三) The Fiehn library The Fiehn library(FiehnLib)数据库中含有超过2200个EI质谱图和RIs,这些信息来源于大于1000个分子量在550Da的代谢物,覆盖了包括脂类、氨基酸、脂肪酸、胺类、醇类、糖类、氨基糖类、糖醇类、糖酸类、有机磷酸盐类、羟基酸类、芳香类、嘌呤类和...