伴随着2020年度新冠疫情的爆发,全球各类机构针对微生物组学的研究热情空前高涨。 微生物组学研究技术种类繁多,大致可分为四类:传统分子生物学技术(如FISH、RFLP和SIP等)、测序技术(扩增子测序、宏基因组和宏转录组等)、质谱技术(宏蛋白组、宏代谢组等)和其他技术。当前基于单一组学技术已经很难满足科研工作者开展课题...
挥发性物质代谢组学(GC-MS) :利用气相色谱-质谱联用(GC-MS)技术,使用顶空(固相微萃取)(HS-SPME)的方式进行样本前处理,特异性的检出一些易挥发性的物质,涵盖醇类、醛类、酯类、酮类、有机酸类、苯(酚)类、烃类、呋喃类、含硫与杂环化合物等类别。 挥发性物质代谢组学(GC*GC全二维):采用全二维气相色谱-质谱...
该研究利用GC-MS代谢组学和LC-MS代谢组学的双平台代谢组学研究方法对Solanum lycopersicum和野生番茄品种的不同组织进行了代谢组学研究,通过结合公开发表的RNA测序数据,构建了多酚代谢的物种特异性代谢网络,建立了多酚代谢生物合成框架,注释了参与类黄酮途径代谢产物及基因表达情况。
通过整合GC-MS非靶标代谢组学和转录组测序数据,发现根际微生物群对植物关键功能的调控发挥重要作用,揭示了拟南芥根部微生物将色氨酸转化为植物激素吲哚乙酸从而延迟开花的代谢调控网络和作用机制。
首先，使用基于GC-MS非靶向代谢组学测定AgNPs或水干预24 h的水稻种子中代谢物。如图3A所示，OPLS-DA评分图表明两组之间有明显的分离。这表明AgNPs-启动在启动24小时内显著改变了水稻种子的代谢物谱。换句话说，AgNPs引发导致水稻种子中的代谢重编程。AgNPs增加了参与应激信号转导的几种代谢物的水平。例如，水杨酸（SA...
GC-MS检测也被称为气相色谱-质谱联用检测,GC-MS法是将气相色谱发与质谱法进行结合的一种测定技术,因GC-MS检测是通过气相色谱与质谱进行联用而实现的,所以其同时具有气相色谱的高分离效率和质谱的高灵敏度这两种特点,这大大提高了GC-MS检测的效率及结果准确度,GC-MS检测能将化合物进行高效分离,并能准确获得化合...
首先,使用基于GC-MS非靶向代谢组学测定AgNPs或水干预24 h的水稻种子中代谢物。如图3A所示,OPLS-DA评分图表明两组之间有明显的分离。这表明AgNPs-启动在启动24小时内显著改变了水稻种子的代谢物谱。换句话说,AgNPs引发导致水稻种子中的代谢重编程。 AgNPs增加了参与应激信号转导的几种代谢物的水平。例如,水杨酸(SA)...
运用组学技术:GC-MS非靶向代谢组学、转录组学 研究背景 植物已经进化出复杂的防御系统来应对各种非生物和生物胁迫,这种能力可以通过压力/免疫刺激来增强。使用预刺激,可以预先调节植物非生物胁迫/免疫系统,从而在随后的非生物和生物胁迫下更快,更强烈地激活防御反应。
运用生物技术:16S rRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持) 研究背景 银纳米颗粒(AgNPs)是使用最广泛的工程纳米材料之一,泄露可能导致颗粒在土壤中积累,并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生显著影响,但对其机理了解甚少。土壤代谢物可...
近日,复旦大学附属肿瘤医院马延磊团队在著名生物医学1区杂志《Theranostics》(2018 IF: 8.063)上发表论文,报道了16s rRNA基因测序联合非靶向GC-MS代谢组学分析手段能够鉴别出健康志愿者和CRC患者的特征性微生物群以及具有疾病表型的相关不同小分子代谢物。 论文截图...