得到GC-MS代谢组学数据后,我们将要进行数据分析,这时候谱图匹配中一定少不了数据库,GC-MS常用的公共数据库有NIST、Fiehn等。 NIST化学数据库 NIST化学数据库由美国国家科学技术研究院 (NIST)等建立,NIST共包含超过16万中代谢物的20多万张EI质谱图,最新版的NIST数据库中也包含了小分子化合物的ESI MS/MS质谱图,...
骨髓间充质干细胞的GC-MS非靶代谢组学分析 共有49个差异显著代谢物,主要由碳水化合物、氨基酸、核苷酸及其中间代谢物组成。代谢组图显示,不同的代谢物在糖酵解、糖异生、三羧酸循环和半乳糖代谢途径中富集。这些途径参与糖代谢和氨基酸代谢,这分别是能量生产和蛋白质合成所必需的。(x轴表示途径的影响,y轴表示途...
在代谢组学研究中,GC-MS和LC-MS是两种比较常用的检测平台,Web of Science 的数据显示,LC-MS是目前最主要的代谢组学分析平台。目前医学代谢组学的研究大多集中在临床医学、药理分析领域,而其试验样本大多为人体尿液、血浆、细胞、组织等,这些样本中的代谢...
主成分分析还表明，两个品种的VOC谱是分离的，生物学上的重复相同品种被紧密地分组（图2C)。这些结果表明，代谢组数据具有较高的可重复性，便于进一步分析，且两个品种的VOC谱不同。图2 | 代谢组学分析概述 通过GC-MS代谢组学研究表明，两个不同品种之间的LJFs的挥发性有机物水平有很大的差异。共鉴定出153个...
GC-MS的适用范围:主要取决于化合物的性能,一般适用于分子量小、易挥发的代谢物,详情如下图: GC-MS 优势及流程 运用GC-MS代谢组学探究优势: 技术成熟稳定、分辨率高、选择性好; 具有相对完善的数据库; 适合于复杂基质的分析,一次分析提供全面的信息;
代谢组学流程图(GC-MS为例) 设计实验 制备样品 分析检测数据采集 数据预处理 代谢物定性统计学分析 差异代谢物筛 选 代谢通路分析 内容提要 •代谢物定性方法 •代谢物定量方法 •多元统计分析 •代谢通路分析 物质鉴定方法I(与已有数据库与发表结果比较) ...
GC-MS非靶向代谢组学检测通过气质联用(GC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有显著变化的代谢物,进而研究这些小分子代谢物变化,实现对生命科学中更多问题的探索。 GC-MS(气质联用)相关介绍
LC-MS灵敏度较高,能分离上千种小分子代谢物,检测限为ppb(即十亿分之一),可用于痕量分析。GC-MS 在代谢组学的研究中除了作为靶向性物质的分析,亦或作为LC-MS非靶向性代谢组学的热稳定化合物的一种补充。两者因为流动相和检测原理的差别,从而得到的数据也是有一定区别的。下面我们将从数据库、离子源、数据形式...
GC-MS非靶标代谢组学检测通过气质联用(GC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有显著变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大都是分子量1500Da以内的小分子物质。