https://github.com/inab/trimal 或者使用Gblocks: http://www.phylogeny.fr/one_task.cgi?task_type=gblocks 4.IQ-Tree:以ML法构建系统进化树 http://www.iqtree.org/doc/Quickstart 5.树的呈现:MEGA-X、FigTree、iTol、Chiplot MEGA:https://www.megasoftware.net/ FigTree:http://tree.bio.ed.ac.u...
具有批处理能力的系统发育工作流,包括序列比对(mafft和macse),比对优化(trimAl,HmmCleaner和Gblocks),数据集级联,最佳分区方案和最佳进化模型选择(PartitionFinder和modelfinder),以及系统发生推断(MrBayes和iq-tree)。figtree是一款用于进化生物学的进化树作图软件,常用于进化树的美化,可以设置颜色、名称、样式等参数。
https://github.com/inab/trimal 或者使用Gblocks: http://www.phylogeny.fr/one_task.cgi?task_type=gblocks 4.IQ-Tree:以ML法构建系统进化树 http://www.iqtree.org/doc/Quickstart 5.树的呈现:MEGA-X、FigTree、iTol、Chiplot MEGA:https://www.megasoftware.net/ FigTree:http://tree.bio.ed.ac.u...