不能运行吗 external='./xtb.sh'sh是bash, windows系统没有bash, 用wsl就可以了
7 xtb的安装参考http://sobereva.com/421 解压命令 tar zxvf crest.tgz 8 Molclus安装参考:http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html 9 gaussian安装参考:http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html 10 ORCA 的安装参考:http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=11697&extra=page%...
将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析 http://sobereva.com/421（http://...
https://github.com/grimme-lab/xtb の右側のreleaseからWindows用のバイナリをダウンロードして適当な場所に置きます。ここでは D:\programs\xtb-6.6.1 においたものとします。 適当な分子構造ビューワを用意します (Jmolなど)。 Gaussian for Windowsを利用する場合、インストールします。ここで...
1/bin/xtb fragment.coord --opt verytight --input scan.inp --chrg 0 --uhf 0 4. Convet xyz into sdf obabel -ixyz xtbscan.log -osdf -O xtbscan.sdf 5. Extract dihedral scan result: extract_result_from_xtbscan.py xtbscan.sdf 3 2 1 8 CONF_ID,Angle,Relative_energy CONF_1,-...
xtb的输入文件就是一个xyz文件,这是最常用的记录分子结构的格式之一,很多程序都可以产生。用Multiwfn产生也可以,可以把fch、pdb、mol、wfn、wfx、molden等Multiwfn能认的格式载入Multiwfn,然后进入主功能100的子功能2,选择输出xyz文件。由于这个文件格式非常简单,比如自己把Gaussian的.gjf文件编辑一下产生也可以。 xtb...
并且使得xtb振动分析结果能够被gview来可视化，从而弥补xtb的不足、极大地扩展xtb的实用价值。本文Gaussian...
比如可能可以用来代替Gaussian默认的Harris泛函做法）。但由于xtb不开源，是否最终能实现这就看他以及其它...
首先用的xtb，得到了TS结构，freq和IRC都是合理的 再把TS结构用GAUSSIAN计算，输入文件1是这样的：# ...