碰到这种情况,最佳的解决方法是在gview观看振动模式的界面中选中虚频模式,选上Manual Displacement并拉动滑条来沿着虚频模式略微调整结构,然后点save structure得到新的结构,再拿这个新结构保存新的输入文件,重新优化和做振动分析后通常就已经没虚频了。有时候对于大体系,也可能因为某些局部区域的初始对称性太高,一直维持到...
此时就应该选择更合适的方法做振动分析以及对应的优化。例如对于弱相互作用对结构影响显著的时候可以用M06...
5 如果上述做法都不灵,干脆改成loose收敛限,但如果之后做振动分析容易有虚频 http://sobereva.com/164 如改为: # opt=gdiis b3lyp/3-21+g* scrf=(iefpcm,solvent=water) em=gd3bj 采用em=gd3bj加色散校正。 可以将失败的log文件导入gaussianview,勾选read intermediate geometries(optimizations),可以在右键中...
首先通过GaussView建立多巴胺分析模型,保存为.gjf文件并修改如下图所示,即在b3lyp/6-311g**精度下进行结构优化(opt)并对优化所得的稳定结构计算振动模式(freq)。该计算也可拆分成两次进行,即先单独进行结构优化,再对优化所得结构单独进行振动分析。但应注意两次计算所采用的理论方法、基组等参数必须完全一致。进行振动...
得到的优化最后一帧有一个-1464的虚频，对应振动方向为初猜的反应方向。于是保存这一帧、改关键词为opt...
顺带提醒一下,初学者千万不要乱冻结,否则可能中途出错,或者难收敛,或者结果缺乏物理意义。冻结时一定要先搞清楚目的。另外,只要是做了冻结,那么优化肯定不会收敛到全局空间极小点,而只能够收敛到扣除被冻结变量的子空间当中的极小点去,因此用这样的结构再做振动分析,往往会出现虚频,这是非常正常的。
你的这个问题我也碰到过，我觉得它是抽风了。建议是将分子换一下坐标，再换用一些含有赝势的基组代替...
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产⽣的原⼦的振动坐标加到相应的输⼊⽂件中。这样，重新计算。直到 虚频没有。4 实际上，如果分⼦柔性较⼤，很难找到最低点，这是电⼦结构计算的问题，这种情况下，需要动⼒学的东西，⽤构象搜寻的办法解决。如：模拟退⽕，最陡下降法，淬⽕法等。将得到的能量最低的构象做 ⼀般的电⼦...
Gaussian程序分子几何结构优化中的收敛与对称性问题 优化收敛问题(2)问题 力过大优化结构的Hessian矩阵出现负本征值 Hessian矩阵的本征值太大(少见)优化步数太多 引起原因 (a)初始构型太差(b)分子坐标选择得不好(a)结构没有优化到极小点(b)Hessian矩阵更新中数值计算错误 (a)Hessian矩阵初猜不好(b)Hessian矩阵...