为此，从AmberTools20里面找到了gaff.dat和gaff2.dat的力场文件，对照Gaussian16自带的amber.prm，写了个...
sobtop的参数文件形式和gaff2.dat的内容是一样的，想用就自己把内容覆盖掉原先的即可 ...
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Gaff力场是由美国Cornell大学开发的一种力场模型,可用于描述各种有机和生物分子的分子力学行为。Gaff力场使用参数化方法,将分子中的原子和键与经验规则相匹配,并根据实验和计算结果进行调整。 Gaff力场分子模型基于分子力学的原理,通过计算力场势能函数来描述分子的结构和行为。力场势能函数由键能、角能、扭转能、非键能...
是用的能量对角度(rad)的二阶导。Amber力场文件里(parm99.dat, gaff.dat)也是同样的单位。你说的...
GAFF很普适也很好，GAFF能用的情况下，比起UFF这种只能用来凑合的力场往往强得多。虽然对于MOF还有其它...