假设我们已经有了一个包含 SNP 信息的 FST 文件,我们可以用以下代码读取 FST 文件: data<-read_fst("path/to/your/data.fst") 1. 确保将"path/to/your/data.fst"替换为你的实际文件路径。 3. 数据预处理 曼哈顿图需要特定格式的数据,通常包括 SNP ID、染色体号、位置以及 P 值。我们将以下面的格式假定...
-1.把Fst值较高的区域(比如前百分之1)当成岛屿(或者Dxy值，这里以Fst为例) (但为什么要这样做我并不明白)。0. Fst/Pi/Dxy是什么 略 1.Fst值(还有Dxy,Pi)的计算 1.1 工具 https://github.com/simonhmartin/genomics_general 使用的是这里的脚本(也可以用vcftools)...
目前这个平滑的脚本没有添加阈值线这个功能。