Binary segmentation: 为每个类的分割产生二值化分割图像 Partial volume maps:默认输出,每个类的分割结果是以概率表示的,值在[0, 1]比如在白质分割结果中,每个体素的概率值表示它属于白质的概率。 Restored input: 如果需要校正图像,则选上 Bias field:这是...
此外,如果您正在分割 T2 加权图像,最好设为 4 类,以便正确处理暗黑非脑物质(这不是 T1 加权的问题,因为 CSF 和暗非脑物质看起来相似)。 各种输出图像包括 Binary segmentation: 为每个类的分割产生二值化分割图像 Partial volume maps: 默认输出,每个类的分割结果是以概率表示的,值在[0, 1]比如在白质分割结...
Use a-priori probability mapstells FAST to start by registering the input image to standard space and then use standard tissue-type probability maps (from the MNI152 dataset) instead of the initial K-means segmentation, in order to estimate the initial parameters of the classes. This can help ...
FAST(FMRIB's Automated Segmentation Tool)主要分割全脑灰质GM、白质WM和脑脊液CSF 在运行FAST之前,应该使用BET剥头皮 处理上百个数据会耗费很长时间,为了提高效率,可以利用qsub和PBS将任务提交到cluster上 指令的详细说明在官网可见BET,FAST 结构像文件结构如下图所示(设当前路径为pwd),每一个人的结构像都放在相应文...
FAST (FMRIB’s Automated Segmentation Tool)采用的算法是隐马尔科夫随机场模型,以及相关的EM算法(Expectation-Maximization). FAST Usage fast [options] [input_nifti_file] [output_nifti_file] [options]: -t <n> or --type=<n> : type of image (n=1 for T1, n=2 for T2, n=3 for PD) -n...