Use a-priori probability maps:使用先验概率图告诉 FAST 首先将输入图像配准到标准空间,然后使用标准组织类型概率图(来自 MNI152 数据集)而不是初始 K-means 分割,以估计初始参数类。这在偏场非常差的情况下会有所帮助。默认情况下,先验概率图仅用于初始化...
Use a-priori probability maps: 使用先验概率图告诉 FAST 首先将输入图像配准到标准空间,然后使用标准组织类型概率图(来自 MNI152 数据集)而不是初始 K-means 分割,以估计初始参数类。这在偏场非常差的情况下会有所帮助。默认情况下,先验概率图仅用于初始化分割 高级选项中的参数通常默认就好,如果分割不理想,再调...
该任务就相当于是对大脑组织进行三类分割。 这里就可以用到FAST功能。 3. 配准 配准功能也是非常强大,内置了很多个标准空间。 这里使用的功能FLIRT:线性变换,FNIRT:非线性变换 但是,无论是分割还是配准,都有局限性:只对 MRI 脑数据有作用, 因为FSL 本身就...
上述中,我们只是把脑组织从图像里分割出来,更进一步,我们可以对脑实质进行分割,分割出白质(WM),灰质(GM)以及核团(CSF)。 该任务就相当于是对大脑组织进行三类分割。 这里就可以用到FAST功能。 3. 配准 配准功能也是非常强大,内置了很多个标准空间。 这里使用的功能FLIRT:线性变换,FNIRT:非线性变换 但是,无论是...
FAST(FMRIB's Automated Segmentation Tool)主要分割全脑灰质GM、白质WM和脑脊液CSF 在运行FAST之前，应该使用BET剥头皮 处理上百个数据会耗费很长时间，为了提高效率，可以利用qsub和PBS将任务提交到cluster上 指令的详细说明在官网可见 BET , FAST 结构像文件结构如下图所示(设当前路径为pwd)，每一个人...
2. 分割之–组织分割 上述中,我们只是把脑组织从图像里分割出来,更进一步,我们可以对脑实质进行分割,分割出白质(WM),灰质(GM)以及核团(CSF)。 该任务就相当于是对大脑组织进行三类分割。 这里就可以用到FAST功能。 3. 配准 配准功能也是非常强大,内置了很多个标准空间。
这里就可以用到FAST功能。 3. 配准 配准功能也是非常强大,内置了很多个标准空间。 这里使用的功能FLIRT:线性变换,FNIRT:非线性变换 但是,无论是分割还是配准,都有局限性:只对 MRI 脑数据有作用,因为FSL 本身就是脑影像数据处理软件。 那我们不做 MRI 脑数据,这个工具还能干什么呢?
667 3 20:53 App FSL官方教学视频中文版:7.分割:FAST 3819 0 10:05 App FSL官方教学视频中文版:1.Unix简介-1 1623 0 28:50 App FSL官方教学视频中文版:2.配准: 图像空间和空间变换 1830 0 39:25 App FSL官方教学视频中文版:6. FSL课程前言-1 814 0 14:31 App FSL官方教学视频中文版:9.分割:白质...
FSL官方教学视频中文版:7.分割:FAST 20:53 FSL官方教学视频中文版:8.分割:皮层下结构和FIRST 22:02 FSL官方教学视频中文版:9.分割:白质高信号和BIANCA 14:31 FSL官方教学视频中文版:10.分割:使用FSL-VBM和SIENA进行结构分析 29:33 FSL官方教学视频中文版:11.FMRI1:任务态FMRI实验和分析简介 13:37 ...
分割: T1_fast_pve_0.nii.gz, T1_fast_pve_1.nii.gz, T1_fast_pve_2.nii.gz - partial volume segmentations (CSF, GM, WM respectively) 皮层下分割: T1_subcort_seg.nii.gz - summary image of all subcortical segmentations. All other outputs in the first_results subdirectory. 一个实例 fsl...