FPKM(Fragments Per Kilobase of transcript per Million mapped reads)这是一种常用的标准化方法,用于比较不同样本中基因的表达水平。FPKM考虑了每个基因的长度和测序深度,使得不同基因和不同样本之间的表达量可以直接比较。 然后,FPKM-UQ是FPKM的一个变体,它在计算FPKM之后,还进行了一个额外的标准化步骤。在这个步...
2。 fpkm,fpkm-uq两个都是经过校正的,具体怎么校正的可以看下面的图, 日常看公式迷糊的小伙伴,我用简单的话讲一下,fpkm就是它把总的基因全长和测序深度这个因素给排除掉了,10^3标准化了基因长度的影响,10^6标准化了测序深度的影响。所以无论你基因组有多长,测序深度有多深,这个因素已经不影响了,所以它适用...
第二步:FPKM 和 FPKM-UQ 的区别: FPKM=RiR100∗Li∗109 FPKMUQ=RiR75∗Li∗109 where, R_i 指的是align到基因i的reads数,R_100 指的是align到所有编码基因的reads数,R_75 指的是align到75%分位的编码基因的reads数(我估计是按照reads数排列),Li 指基因i的长度 两者的唯一差别在于分母校正的不同...
FPKM-UQ = (1,000)*(10^9)/[(3,000)*(2,000)] = 166,666.67 那么我们一般下载那种数据比较好呢? 如果是做差异分析的话,我建议采用counts ,毕竟有不少的差异分析的软件都是基于counts数。 如果是计算样品间的相关性,聚类等,那就可以采用均一化的FPKM,和FPKM-UQ。当然下载counts,之后进行标准化,也是可...
故FPKM = RPKM / 2 TPM TPM(transcript per million), 基因FPKM 占总的FPKM的比例, TPM衡量基因在样本中的相对表达量,对同一个基因不同样本,其FPKM可能相同,但相对所有基因而言,其在不同样本中可能所占比例不同。 TPM = gene_fpkm / total_fpkm * 10^6...
一、于淑荣担任职务:于淑荣目前担任市北区孟家船家鱼菜馆法定代表人,同时担任青岛振华前行教育管理有限公司监事;二、于淑荣投资情况:目前于淑荣投资市北区孟家船家鱼菜馆最终收益股份为0%;三、于淑荣的商业合作伙伴:基于公开数据展示,于淑荣与张维欣为商业合作伙伴。 财产...
好评5.0 接诊量6.7千 同行认可99 从业29年 服务态度好 专业有效 耐心细致 问题描述:你好医生,白细泡高,要输液吗,鼻子不通气(女,28) 分析及建议: 应该是哌拉西林,抗生素,一类药,如果面诊排除新冠,考虑是上火感冒以后引起的鼻腔感染(例如鼻窦炎,感冒鼻窦炎都会引起头疼,可以自己买个洗鼻器温生理盐水冲洗鼻腔。
人生·消炎生肌膏 20g/支/盒 人生·消炎生肌膏 20g/支/盒 药师简介 使用须知 该药用几天伤口会愈合 消炎生肌膏的用法用量为:外用,摊于纱布上贴敷患处,每隔一至二日换药1次。关于使用消炎生肌膏后伤口几天会愈合的问题,需要根据伤口的大小、深度、位置以及个体差异等因素来具体评估。一般来说,浅表性...
分析下面两个句子意义上的差别。(8分) 根据您输入的内容,为您匹配到题目: 分析下面两个句子意义上的差别。(8分) A. 小李,你赶快上来帮忙啊! B. 小李,你赶快上去帮忙啊1 答案:答:a.说话人在上方,小李在下方,说话人当时不在...
问:有红血丝角质层薄的人可以运动吗。会不会运动热导致毛细血管扩张然后红血丝反复这样好不了了(女,16岁) 答:这个运动的话不影响!你这个的主要那些激素品不能用,然后不能用那种去角质的,这个皮肤角质层修复以后会好的,但是需要时间,尽量避免生气,情绪激动血管也会