Theformatdb.exeprogram is part of the BLAST release, which can be found here: ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/release/2.2.18 在对核苷酸或蛋白质序列数据库进行Blast搜索之前,必须要对所使用的序列数据库进行formatdb, 即对序列数 据库进行格式化,这是所有使用BLAST所必须的一步。 格式化序列数据...
default = T -a 输入数据库的格式是ASN.1(否则是FASTA) T - True, F - False. [T/F] Optional default = F -o 解析选项 T - True: 解析序列标识并且建立目录 F - False: 与上相反 [T/F] Optional default = F
新装了系统，有些原来的程序就不能用了，重新安装一下试试。不行的话就把这个程序卸载，重新下。
Wrapper script that calls formatdb on nr database and then runs blastall against formatted db and parses the output. - GitHub - lvn3668/paralogIdentification: Wrapper script that calls formatdb on nr database and then runs blastall against formatted db