Coregistration 🧠 将功能图像与高分辨率的T1加权结构图像配准在一起。 Segmentation and Normalization 🧬 使用SPM的segmentation模块将T1图像分割为灰质、白质和脑脊液,并通过DARTEL或unified segmentation算法将这些图像空间标准化到标准模板如MNI空间。 Spatial Smoothing 🌐 应用高斯平滑滤波器来增加信号的信噪比。 Tempo...
具体步骤:先bet去除头皮干扰,然后结构像去配准功能像,后再应用到之前未去头皮的结构像,再去segment分割(带着头皮分割效果好,bet也有可能损伤) (6)T1 Coreg Fun:结构像配到功能像空间 (7)segment:把大脑的结构像分割成灰质、白质和脑脊液,是老的segment不用 用new segment+DARTEL: 36min segment生成的结果: (8...
具体步骤:先bet去除头皮干扰,然后结构像去配准功能像,后再应用到之前未去头皮的结构像,再去segment分割(带着头皮分割效果好,bet也有可能损伤) (6)T1 Coreg Fun:结构像配到功能像空间 (7)segment:把大脑的结构像分割成灰质、白质和脑脊液,是老的segment不用 用new segment+DARTEL: 36min segment生成的结果: (8...
通过DARTEL估计的参数将功能像配准到蒙特利尔神经科研研究所(montreal neurological institute,MNI)标准空间,并以3 mm各向同性体素进行重新采样;⑥采用4 mm半高宽的高斯核函数进行平滑,以降低空间噪声、减少过程中所产生的误差;⑦最后步骤为去线性漂移并应用0.01~0.1 Hz带通滤波去噪,以降低低频数据引起的漂移和高频的生理...
四、与处理步骤有关的参数设置 DPARSF 提供了一些参数模板,选择不同的参数模板来调整分析流程。默认情况下是 V4:Calculate in MNI Space (warp by DARTEL) ,主要处理步骤包括(1)时间层校正(Slice Timing)、(2)头动校 正 ( Realign ) 、 ( 3 ) T1-fMRI 图像配准 ( co ...
主要内容 •脑成像数据分析软件介绍•Matlab基本知识•SPM基本知识•利用SPM处理任务fMRI数据（原理和操作）•任务态fMRI数据处理技巧 脑成像数据分析软件 •SPM(statisticalparametricmapping)–Matlab-based–TaskfMRI,MRI(VBM),PET/SPECT,EEG/MEG–Course,manual,Wiki,Email-list •AFNI(AnalysisofFunctional...
在VBM8中单独处理训练和预测数据以避免bias(这里可以理解为由于共同数据处理带来的数据特征的相似性从而造成的bias,因为作者使用了DARTEL的算法来进行结构数据的分割和配准)。 VBM8工具箱的第一个模块将三维T1加权图像分割为GM,白质和脑脊液,并通过DARTEL算法配准到MNI空间。在去除非脑部分后,组织分类密度图被配准到模板...
平均图被进一步分割为灰白质。随机选择20例TBI及20例健康被试通过DARTEL得到一个研究特异性纵向模板,通过仿射变换至MNI52空间。个体的平均图及雅克比行列式图像通过纵向模板配准至MNI152模板(8mm平滑)。 B(ii)纵向分析包括基于体素的组间比较,采用Randomise,感兴趣区分析采用FreeSurfer (Destriuex)atlas及组织分割(灰白...
具体步骤是先对每个被试的T1图像进行分割,得到CSF(脑脊液)、白质和灰质。然后使用了DARTEL的方法进行了配准。然后基于绝对平均曲率提取局部曲率皮层褶皱指数AMC。然后分别得到双侧大脑半球的皮层表面。最后,对所有图像进行了重采样,并使用20mm的高斯核进行空间平滑。