大家好,芬兰数据库(FinnGen)也是我们做孟德尔随机化研究必备的一个数据库,之我发了R8的下载整理方法,放在了VIP群。 目前芬兰数据库更新到R9了,前几天我发了下载方法,基本上可以一次性把所有的性状下载完毕:孟德尔随机化必备数据——芬兰数据库FinnGen R9数据下载。 这两天有空写了一下怎么把R9的数据整理成完美地
芬兰数据库FinnGen R9数据可以转化为适合两样本孟德尔随机化分析的暴露或结局数据。具体转化方法如下：数据下载与准备：一次性下载：FinnGen R9版本提供了所有性状的一次性下载途径，简化了数据获取过程。数据整理：遵循先前发布的指南，对下载的数据进行整理，以便后续分析。自动化处理：提升自动化程度：FinnGe...
背景：骨坏死是一种导致关节功能严重受限的骨科疾病，其发病机制涉及多种风险因素。组织蛋白酶作为一类在骨代谢中起关键作用的酶，其活性与骨细胞的增殖、分化及骨基质的重塑密切相关。然而，以往研究多集中于描述性分析，缺乏对因果关系的直接证据。目的：通过分析FinnGen数据库中的大规模欧洲人群样本数据，明确组织蛋白...
方法：神经影像学数据来自英国的UKBiobank数据库，该数据共纳入36778名个体；骨坏死数据来自芬兰的FinnGen数据库，包括1543例病例和391037例对照。从结局因子中提取筛选出工具变量，进行两样本孟德尔随机化分析，通过逆方差加权法、MR-Egger、加权中位数法、简单模型法和加权模型法对数据进行分析，以逆方差加权法为主要分...
近日,美国Biogen公司Heiko Runz研究组以及Benjamin B. Sun(第一作者)在Nature上发表文章Genetic associations of protein-coding variants in human disease,通过对英国生物样本银行以及FinnGen基因组数据库之间的关联分析,弥补了对于罕见变异与...
微量元素孟德尔随机化..《微量元素孟德尔随机化分析》《SMR孟德尔随机化分析》《2024新版TCGA数据下载和整理》《肠道菌联合免疫细胞孟德尔随机化》《三级淋巴结构文章套路》《炎症因子中介孟德尔随机化》《脂质体中介孟德尔随机
SMR孟德尔随机化分析(FinnGen数据库/曼哈顿图/eQTLGen/GTEx)(我的✅yax1367901) 学习分享bili_25713276574 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多7 -- 0:06 App 达内2024-新版Linux云计算运维 (我的✅yax1367901) 学习分享 5 -- 0:06 App NEJM不是梦,Case Report(我的✅yax1367901) 学习...
GWAS数据使用的是芬兰的数据,下载方式可参考:孟德尔随机化必备数据——芬兰数据库FinnGen R9数据下载。 下载的数据均无需解压,放在工作目录即可。代码是傻瓜式的,只需把最上面2个数据修改为你自己的数据即可。最后的结果是这样的: 可以看到,有一个SNP的H4值达到了1,妥妥的强共定位,因此该SNP为2个性状的共享因果...
https://storage.googleapis.com/finngen-public-data-r9/summary_stats/R9_manifest.tsv 该表格列出了目前FinnGen项目公开发布的所有GWAS结果的数据,包括疾病、表型、样本量等信息。 FinnGen数据库的优势在于: 样本量大:包含了超过140万芬兰参与者的基因组数据 电子健康记录:结合了参与者的电子健康记录数据,进行GWAS...
通过各种渠道，我成功下载了芬兰（FinnGen）数据库的全部目录，其中包括了GWAS链接。如果你需要这些资源，只需留下你的邮箱，我将免费分享给你。我理解初学者在学习过程中遇到问题的困扰，特别是英语水平一般的情况，寻找帮助往往不易。虽然我并非专家，仅是普通的初学者，但愿意与他人分享资源，解答问题，...