FFPE石蜡样本由于甲醛处理形成的多聚体，导致某些活性裂解位点被掩盖，阻碍胰蛋白酶到达其活性裂解位点，导致酶解不完全，需要特殊前处理，欧易生物对FFPE处理流程技术改进脱蜡+水化解交联+超微量样本酶切前处理方法方式：使石蜡去除更干净、有效解除甲醛的共价交联，增加蛋白的溶解度，使得蛋白提取得率更高、酶解效率更高...
对于从FFPE样本中提取的核酸，一般通过吸光度检测仪器Nanodrop，荧光定量仪Qubit及毛细管电泳仪进行测定核酸浓度、OD值（纯度）及片段大小(DIN)。对于核酸的质控是非常重要的，因为提取的核酸质量会影响下游的实验结果。参考文献 [1] Klopfleisch R, Weiss AT, Gruber AD. Excavation of a buried treasure--DNA, mRNA...
现阶段在FFPE样本中提取核酸仍存在一定的挑战性，如样本在提取环节降解严重，影响后续实验的成功率；或是在提取之前，由于储存时间较长，储存温度非低温，导致降解严重等。FFPE样本提取难点凡知医学通过不断打磨，将FFPE样本RNA提取的性能全面升级，采用独特的磁珠和精心优化的缓冲体系，面对不同降解程度的FFPE片段，可最...
FFPE 之所以能够推进科研重大成果,成为医学研究和临床病理诊断中不可或缺的样本处理技术,与它的特质相关:比如 FFPE 样本可以在室温下保存数十年,不受时间限制,便于长期研究和样本库的建立;FFPE 技术有效固定组织结构,保持细胞和组织的原有形态,对病理...
福尔马林固定石蜡包埋样本FFPE (Formalin-Fixed and Parrffin Embedded),是临床病理科长期保存病理样本的标准方法,因此通常FFPE样本库里面涵盖了大量珍贵样本,是进行回顾性研究最好的选择。但是由于FFPE样本制作包含了样本固定等实验步骤,导致了组织内分子断裂、造成RNA降解严重,从而检测难度很大。近些年随着技术的逐步发展,...
FFPE样本( Formalin Fixed Paraffin Embedded,简称FFPE),即经过福尔马林固定和石蜡包埋处理的组织样本,是医学研究和临床病理诊断中不可或缺的材料。它们通过固定过程保持组织结构的完整性和形态,允许长期保…
影响FFPE样本中核酸质量的因素 一般核酸提取纯化有三个质检指标：核酸浓度、核酸纯度及核酸完整度，而FFPE样本由于福尔马林处理，损伤核酸，影响下游应用数据的真实性，提高了核酸提取难度。一般来说FFPE 样本可以保存长达数年时间，但超过一年的FFPE样本不建议用于NGS实验。即使在一年内，随着保存时间的增加，DNA的片段化...
表1 影响FFPE样本中DNA质量的主要因素 ■ 如何提高FFPE样本的建库质量? 1.样本质量控制 对于高质量的DNA样本,通过吸光度检测样品纯度(Nanodrop)和荧光定量(Qubit)进行质量检测即可,但是这对于FFPE样本来源的DNA是远远不够的, 需要进一步的质控评估。目前主要的方法有以下两种: ...
FFPE样本核酸提取的通用步骤为脱蜡、裂解-解交联、纯化、回收。具体步骤参照不同试剂盒说明书进行操作。1）脱蜡 用手术刀片刮取玻片上的样本至取样管中，加入去蜡剂震荡混匀进行脱蜡暴露组织。2）裂解-解交联 利用裂解液与蛋白酶在一定温度下进行组织裂解与解交联。3）核酸纯化 采用不同核酸纯化方法纯化DNA或RNA。4...
FFPE DNA修复试剂可搭配市面上通用的建库产品,完成FFPE样本的损伤修复;配合翌圣生物Hieff NGS®UltimaDNA Library Prep Kit(Cat#12199,13310)建库试剂盒使用,只需要把修复试剂加到反应体系中就可以了,不需要额外的操作步骤,很方便呦。 DNA修复显著提高文库产量 ...