下图来源于薛定谔公司Dr. Jenny Chambers的《Introduction to Structure-Based Drug Design》。图里说的很清楚,对接的打分结果和活性(IC50,Kd,EC50)无关,也不能用来对分子的好坏进行排序,仅能作为富集分子的工具。 Docking因为其打分函数不准确以及采样不足限制了这种方法的精度。有其他的CADD工具可以实现么?可以比较准...
下图来源于薛定谔公司Dr. Jenny Chambers的《Introduction to Structure-Based Drug Design》。图里说的很清楚,对接的打分结果和活性(IC50,Kd,EC50)无关,也不能用来对分子的好坏进行排序,仅能作为富集分子的工具。 Docking因为其打分函数不准确以及采样不足限制了这种方法的精度。有其他的CADD工具可以实现么?可以比较准...
图2是FEP results summary,做了左侧所列一些靶点,都是之前有人做过FEP并报道结果的。其中MUE是mean unsigned error,可以简单理解为误差,FEP+ crystal structure指用晶体结构算出来的结果,FEP+ AF2指用AF2 model算出来的结果,这里称为AF2 30是因为预测这些AF2 model的时候,已经把库里与靶点同源性大于30%的模板移除...
FEP的构建基于hybrid topology/ dual topology的体系,以下图为例,我们想比较L8到L9结构改造中的自由能差值,易见它们仅仅差别在于苯到环己烷的变化,其余的部分都可以定义为common structure,在计算时可以保持参数与性质不变。 图四、pseudo dual molecule示例 2.3 dual topology体系的力场参数设计 如图三中,构建好dual to...
磷化三铁 FeP 磷化三铁 is a 化合物 and has a chemical formula of FeP. 一般特性 公式FeP Mass / 摩尔质量+86.908699 Da Structure of 磷化三铁 Oxidation Numbers of FePLewis Structure of FeP [P-3].[Fe+3]
(内硅胶外玻纤)Structure (the silica gel in fiberglass)返回顶部 Back to top
J. Cheminformatics 11, 1–16(2019). 5. Shirts, M. R., Mobley, D. L., Brown, S.P. Free-energy calculations in structure-based drug design In Drug Design (Cambridge University Press, Cambridge, 2010), pp 61−86.©2022 Baidu |由 百度智能云 提供计算服务 | 使用百度前必读 | 文库...
Jenny Chambers的《Introduction to Structure-Based Drug Design》。图里说的很清楚,对接的打分结果和活性(IC50,Kd,EC50)无关,也不能用来对分子的好坏进行排序,仅能作为富集分子的工具。 Docking因为其打分函数不准确以及采样不足限制了这种方法的...
FEP 是四氟乙烯和六氟丙烯共聚而成的,六氟丙烯的含量约15%左右,是聚四氟乙烯的改性材料。全称:氟化乙烯丙烯共聚物(全氟乙烯丙烯共聚物),简称聚全氟乙丙烯,又缩写成 F46。 FEP 结晶熔化点为 580°F,密度为 2.15g/CC(克/立方厘米),它是一种软性塑料,其拉伸强度、耐磨性、抗蠕变性低于许多工程塑料。它是化学...
下图来源于薛定谔公司Dr. Jenny Chambers的《Introduction to Structure-Based Drug Design》。图里说的很清楚,对接的打分结果和活性(IC50,Kd,EC50)无关,也不能用来对分子的好坏进行排序,仅能作为富集分子的工具。 Docking因为其打分函数不准确以及采样不足限制了这种方法的精度。有其他的CADD工具可以实现么?可以比较准...