2. FDR(i)=P(i)*m/i 3. 根据i的取值从大到小,依次执行FDR(i)=min{FDR(i),FDR(i+1)} 注:实际上,BH法的原始算法是找到一个最大的i,满足P≤i/m*FDR阈值,此时,所有小于i的数据就都可以认为是显著的。在实践中,为了能够在比较方便的用不同的FDR阈值对...
fdr值取值范围在0到1之间。一般而言,fdr值越小,结果越可靠。其中:1. fdr值为0,表示在所有拒绝原假设的情况下,没有任何一个是假阳性。这是理想但通常难以达到的情况。2. fdr值为1,表示所有拒绝原假设的情况都可能是假阳性,这意味着结果完全不可靠,没有任何统计学意义。fdr值为1意味着研究结果完全不可信,没有...
一般我们都用count、TPM或FPKM来衡量基因表达水平,所以基因表达值肯定是非负数,那么fold change的取值就是(0, +∞)。 为什么我们经常看到差异基因里负数代表下调、正数代表上调?因为我们用了log2 fold change。 当expr(A) < expr(B)时,B对A的fold change就大于1,log2 fold change就大于0(见下图),B相对A就...
FDR FDR中文名为发现错误率,可以灵活调整取值,作为检验错误率的指标,定义: 这里用菌群举例。 代码: 1a<-res_mi_all$pval 2head(a) 1a<-sort(a) 2head(a) 1p.adjust(a) #可以看到下面结果校正后都不显著 1a[1]<-0.0000000001#给a的第一个...
灵活性:FDR的控制值可以根据需要灵活选取,而FWER的取值则较为固定,通常定为0.05。 明确性:FDR的意义明确,可以作为筛选出的差异变量的评价指标,而FWER则主要是用来控制I类错误的。 阈值选择 在实际应用中,FDR的阈值选择是非常重要的。常用的阈值包括0.01、0.05、0.1等。研究者可以根据实际的需要和数据的特性来灵活选...
平均趋向指数(ADX)(14日)- ADX指标评估了14天的趋势强度,数值越高表明趋势越强。该指标取值范围从0到100,一旦突破25,即代表趋势力量强大。 15日移动均线- 过去15个交易日的平均价。 价格较50日移动均线的百分比- 当前股价相当于50日移动均线的百分之多少。
500个随机匹配中打分最好的匹配的p值小于等于0.01的概率接近于1!也就是说,p值小于等于0.01的筛选也完全无法避免错误匹配的混入啊!难道,这么严格的取值都不足以作为这个肽谱匹配是正确的证据了?! 很遗憾地告诉你,当候选肽段很多的时候,这个证据确实还不够强!
FDR具有的优点包括：1）可以灵活调整其取值，作为假设检验错误率的控制指标，其控制值可以根据需要灵活选取；而传统的假设检验（FWER）的取值则较为固定，通常定为0.05；2）FDR的意义明确，可以作为筛选出的差异变量的评价指标，而FWER主要是用来控制一类错误的。FDR与FWER的关系：当所有无效假设为真时，...
3、相关系数和斜率存在一定关系,可以说,斜率越靠近1,相关系数越大。(相关系数取值-1~1),其中0代表不相关,1代表正相关,-1代表负相关。 4、最佳拟合线的画法:在这里三种方法是等价关系,得到的数值是一样的。(最小二乘法 = 一次拟合 = 一次回归)