易于集成:作为命令行工具,FASTX-Toolkit 可以容易地集成到自动化的数据分析流程中,提高工作效率。 2官网 官网:http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit github: https://github.com/agordon/fastx_toolkit 仅仅是一些小工具集,官网未见有发表专门的文章 3如何安装 conda 安装 省事省力,推荐这个方式 代码语言:javasc...
在NGS数据分析中,常常需要对fasta/fastq文件进行一些处理,fastx_toolkit是一款综合性的工具,提供了很多有用的功能,能够简单方便的处理序列文件。官网如下 http:///fastx_toolkit 官网提供了二进制可执行文件,直接下载即可 wget http:///fastx_toolkit/fastx_toolkit_0.0.13_binaries_Linux_2.6_amd64....
http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit 官网提供了二进制可执行文件,直接下载即可 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 wget http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/fastx_toolkit_0.0.13_binaries_Linux_2.6_amd64.tar.bz2 tar xjvf fastx_toolkit_0.0.13_binaries_Linux_2.6_amd64.tar....
安装fastx_toolkit (gcc, pkg-config) 我需要其中的fastx-clipper,从官网下载http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/download.html最新版本的软件 用tar -jzf进行解压缩,解压缩之后,在文件夹中阅读README 得到提示: 那就安装gcc https://blog.csdn.net/xiaogugood/article/details/18400761 sudo apt-get install...
在NGS数据分析中,常常需要对fasta/fastq文件进行一些处理,fastx_toolkit是一款综合性的工具,提供了很多有用的功能,能够简单方便的处理序列文件。官网如下 http://hannonlab./fastx_toolkit 官网提供了二进制可执行文件,直接下载即可 wget http://hannonlab./fastx_toolkit/fastx_toolkit_0.0.13_binaries_Linux_2.6_amd...
Fastx-Toolkit网址,这里简单说说,更详细的描述使用去官网溜达溜达吧!!! 介绍 FASTX-Toolkit 是用于 Short-Reads FASTA/FASTQ 文件预处理的命令行工具集合。 下一代测序仪通常会生成 FASTA 或 FASTQ 文件,其中包含多个短读序列(可能带有质量信息)。 此类FASTA/FASTQ 文件的主要处理是使用专门的程序将序列映射(也称为...