单细胞转录组数据和普通的bulk转录组还是不太一样,bulk结果一般就是R1、R2,很容易区分;10X单细胞数据比较特殊,它的测序文库中包括index、barcode、UMI和测序reads。 这里我们在解压sra文件变成fastq文件的时候,使用了参数--split-files来输出3个fastq文件,但是它的文件名字并不是 R1和R2这样的格式,而前面的公众号推...
10x的单细胞转录组fastq文件的R1和R2不能弄混哦 原创 正常走cellranger的定量流程即可,代码我已经是多次分享了。参考:10X单细胞转录组原始测序数据的Cell Ranger流程(仅需800元)一个10x单细胞转录组项目从fastq到细胞亚群一文打通单细胞上游:从软件部署到...
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10x的单细胞转录组fastq文件的R1和R2不能弄混哦 展开全文 10X单细胞转录组原始测序数据的Cell Ranger流程(仅需800元) 一个10x单细胞转录组项目从fastq到细胞亚群 一文打通单细胞上游:从软件部署到上游分析 PRJNA713302这个10x单细胞fastq实战 一次曲折且昂贵的单细胞公共数据获取与上游处理 差不多几个小时就可以完成...
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