fastq文件处理流程 处理FASTQ文件通常涉及以下步骤: 1.质量控制(Quality Control,QC):使用工具(如FastQC)检查FASTQ文件中的序列质量,包括碱基质量分布、碱基含量、测序错误率等。 2.去除低质量序列(Trimming):使用工具(如Trimmomatic)去除FASTQ文件中的低质量序列,例如去除末端低质量碱基以及过长的多聚体。 3.质量修正...
我打算使用10X cellranger处理fastq.gz文件,下载及安装方式在官网:https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/downloads/2.0 这个网址写了10X cellranger处理fastq.gz文件的命名规则https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/pipelines/2.0/using/fastq-input#wron...