-j, --json the json format report file name (string [=fastp.json]) -h, --html the html format report file name (string [=fastp.html]) -R, --report_title should be quoted with ' or ", default is "fastp report" (string [=fastp report]) -w, --thread worker thread number, def...
首先,命令的语句是“fastp -i 序列文件名”或者“fastp --in1=序列文件名”,看自己喜欢用哪种。 然后fastp --help调出参数: 然后我从NCBI上下载了一个单端测序的数据试了一下,用时714s,代码见图的最下方: image-20220310093250079.png 其他 参考文献:[1] Chen, S. , Zhou, Y. , Chen, Y. , & Jia...
-T, read2 3‘端裁剪的碱基数 -j, --json the json format report file name (string [=fastp.json])-h, --html -j, --json the json format report file name (string [=fastp.json])-h, --html
fastp使用参数 fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor version 0.20.1 一个超级快速的fastq一条龙处理软件 options:-i,--in1 read1 input file name(string[=])-o,--out1 read1 output file name(string[=])-I,--in2 read2 input file name(string[=])-O,--out2 read2 output fil...