可以使用wget命令下载fastp,因为wget是一个在命令行下使用的下载工具,它支持HTTP、HTTPS和FTP协议,也支持HTTP代理。当用户提供一个URL作为参数给wget时,wget会向该URL发出HTTP请求,并将响应的内容保存到本地文件。所以,只要知道fastp的下载链接,就可以使用wget命令进行下载。所以可以使用wget命令下载。
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第一步:fastp、fastqc软件安装 conda install fastp conda install fastqc 第二步:查看软件路径 #fastp速度更快可以进行质控+过滤,fastqc只进行质控 which fastp which fastqc 第三步:质控+过滤 fastp -i P1_H3B_A.fq -o test.fq
micromamba create-nRNA micromamba activate RNA micromambainstall-y-chcc aspera-cli micromambainstall-y-cbioconda fastqc multiqc fastp samtools star 03.准备文件 https://www.gencodegenes.org/human/ 代码语言:shell AI代码解释 mkdir-p~/DataHub/Genomics/GENCODE/release_42cd~/DataHub/Genomics/GENCODE...
Purely Black - The Moon is Sinking 专辑: 夜カフェ時間 - Breeze of the Night 歌手:Purely Black 还没有歌词哦Purely Black - The Moon is Sinking / 已添加到播放列表 1 播放队列/1 1 The Moon is Sinking Purely Black 01:29Mac版酷狗音乐已更新 就是歌多 详情 下载 ...
1、fastp软件的安装 wget http://opengene.org/fastp/fastp chmod a+x ./fastp 2、数据质控 双端测序 /public/home/ZCH_luxm/software/fastp -i /public/home/ZCH_luxm/NCBI/2_fq/SRR13413579_1.fastq.gz -o /public/home/ZCH_luxm/NCBI/2_fq/SRR13413579_1clean1.fastq.gz -I /public/home/ZCH...
fastp -i $rawdata/SRR1039510_1.fastq.gz \ > -I $rawdata/SRR1039510_2.fastq.gz \ > -o $cleandata/SRR1039510_1.fastp.fq.gz \ > -O $cleandata/SRR1039510_2.fastp.fq.gz \ > -h $cleandata/SRR1039510.fastp.html \ > -j $cleandata/SRR1039510.fastp.json \ > -l 36 -q 30 ...
Fastp是一个用于处理FASTQ文件的超快速全功能FASTQ预处理器。它提供了许多高级功能,如QC、适配器、修剪、过滤、拆分和合并等。 Fastp的主要功能是快速处理FASTQ文件,提高数据处理效率。它可以自动识别并修复FASTQ文件中的错误,如插入/删除/替换错误、序列重复等问题。它还可以根据需要进行序列比对和质量控制,如计算序列...