1. EzBioCloud数据库没有下载接口,且网页是异步加载,所以我们采用urllib+bs4的策略,抓取属内种的信息; 2. 抓取到菌株名和登录号以后就简单多了,直接交给biopython下载就好啦; 3. 当然,通过观察发现,EzBioCloud提供的登录号有些是全基因组序列,那我们就再加一步简单的过滤。 脚本介绍 明确思路以后,一顿劈里啪...
EzBioCloud 16S 数据库:16S rRNA 基因为整个 EzBioCloud 数据库提供了分类框架。基本上,所有物种或亚种都由单个 16S 序列表示,通常来自类型菌株。分层分类基于 16S-最大似然系统发育分析 ,详见:https://help./ezbiocloud-16s-database/ 基因组数据库 EzBioCloud 基因组数据库:EzBioCloud 中包含的所有基因组序列...
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要注册EZBIOCloud,您可以按照以下步骤进行操作:1. 打开EZBIOCloud的官方网站 (https://www.ezbiocloud.net/)。2. 在网站上方的导航栏中,单击"注册"按钮。3. 您将被重定向到注册页面。在该页面上,您将看到一个注册表格。4. 填写注册表格中的必填信息,例如用户名、电子邮件地址和密码。确保您...
EzBioCloud 介绍 对于微生物方向的老师,科研工作中是离不开EzBioCloud数据库的。这是一个由ChunLab维护的专门针对细菌、古菌16S rRNA基因的数据库,但与Greengenes数据库不同的是,该数据库以可培养的细菌、古菌16S rRNA基因序列为主。我们可以通过EzBioCloud数据库的Identify功能确定某一微生物的近缘可培养/模式种。
在微生物多样性比较的时候可以使用这个网站。需要注册一个账号在EZbiocloud, 后面需要有一个单位邮箱验证,然后才能使用该网站的16S blast功能,不过每次好像只能比对一条序列,但是比较可靠。 00 靠谱的问答社区,专注分享知识、经验、观念。在这里,所有人都能找到答案、参与讨论 ...
点进注册页面后,使用自己的手机号码进行注册就可以了。在微生物多样性比较的时候可以使用这个网站。需要注册一个账号在EZbiocloud,后面需要有一个单位邮箱验证,然后才能使用该网站的16Sblast功能,不过每次好像只能比对一条序列,但是比较可靠。
ezbiocloud单位邮箱验证通过企业邮箱设置自己的域名进行免责设置即可。单位邮箱结束企业邮箱,单位邮箱是域名作为后缀的电子邮件地址,一个企业经常有多个员工要使用电子邮件,单位电子邮局可以让集团邮局管理员任意开设不同名字的邮箱,并根据不同的需求设定邮箱的空间,可以随时关闭或者删除这些邮箱。
在微生物多样性比较的时候可以使用这个网站。需要注册一个账号在EZbiocloud, 后面需要有一个单位邮箱验证,然后才能使用该网站的16S blast功能,不过每次好像只能比对一条序列,但是比较可靠。
NCBI上面的序列的准确性相对EzBioCloud要查许多,而且EzBioCloud上面的序列都是所在分类等级的代表,所以...