如果你的显卡只有8G VRAM或者以下权重都不能完整载入GPU中,考虑CPU-Only模式或者ColabFold吧 当你运行的序列很长(大约每240AA会消耗10G VRAM),得到了out of memory的报错之后你可以尝试用" --cpu-offload"这个命令,实际上在安装ESMfold的时候会一并安装DeepSpeed这样就启用了ZeRO,但就结果来说这并不能节约多少VRAM...
除了瘟病毒,预测的结构还帮黄病毒找到了两个「亲戚」——寨卡病毒和登革热病毒,它们的进入蛋白似乎有相同的起源;此外,黄病毒似乎还从细菌那里「窃取」了一种酶并据为己有。 使用ColabFold–AlpahFold2预测登革热病毒蛋白的结构 此前,悉尼大学病毒学家Mary Petrone的团队也曾在一种奇怪的黄病毒中发现了类似的「盗窃」...