上海交通大学和中山大学的研究人员提出了 DeepProSite,用于利用蛋白质结构和序列信息来识别蛋白质结合位点。DeepProSite 首先从 ESMFold 生成蛋白质结构,并从预训练的语言模型生成序列表示。然后,它使用 Graph Transformer 并将结合位点预测制定为图节点分类。在预测蛋白质-蛋白质/肽结合位点时,DeepProSite 在大多数指...
DeepProSite 首先从 ESMFold 生成蛋白质结构,并从预训练的语言模型生成序列表示。然后,它使用 Graph Transformer 并将结合位点预测制定为图节点分类。 在预测蛋白质-蛋白质/肽结合位点时,DeepProSite 在大多数指标上都优于当前基于序列和结构的方法。此外,与基于结构的预测方法相比,DeepProSite 在预测未结合结构时保持...