(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL) google之后怀疑是基因组太大,然后服务器物理内存不够导致的,也可能当时同一时间运行的任务过多。所以重新换了一个大节点。就解决问题了。
hisat2 -t -p 16 -x /work/home/acwnw4bl7y/GRCm39/GRCm39 \ -1 $id -2 ${id%_*}_2.clean.fq.gz \ 2>${id%%_*}.hisat2.log \ |samtools sort -@ 16 -o ${id%_*}_ht2p.bam done srun:ROUTE:split_hostlist:hl=c09r3n13 tree_width0srun:ROUTE:split_hostlist:hl=c09r3n13 t...