QTL指的是多个基因决定某一个性状，比如身高是一个数量性状，其对应的控制基因的位点就是数量性状基因座，而eQTL就是能控制数量性状基因的表达水平高低的那些基因位点。非编码基因的变异即是通过调节基因表达引起疾病的。但是eQTLs在不同组织、不同细胞类型以及不同细胞状态中的效应非常复杂，但这一研究对基因变异与基因...
CancerSplicingQTL提供sQTLs, Survival-sQTLs及GWAS-sQTLs的查询和下载功能,其中查询功能可根据需求填写癌症类型、SNP ID、基因信息、连锁不平衡r²、表型进行单一条件或多条件搜索查询,下载功能可根据癌症类型一键下载相关数据。 动动你的手指,来试试这个癌症研究数据库套装吧! 参考文献 [1]Gong J, Mei S, Liu...
TCHP外显子4和5之间内含子连接点高使用的细胞类型包含顺式sQTL，导致了细胞类型特异性的sQTL-GWAS共定...
QTL指的是多个基因决定某一个性状,比如身高是一个数量性状,其对应的控制基因的位点就是数量性状基因座,而eQTL就是能控制数量性状基因的表达水平高低的那些基因位点。非编码基因的变异即是通过调节基因表达引起疾病的。但是eQTLs在不同组织、...
首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个数量性状,其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点,而eQTL就是控制数量性状表达位点,即能控制数量性状基因(如身高基因)表达水平高低的那些基因的位点。 数量性状基因座:控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用DNA分子标记技术对这些区域进行定位,与连续变...
表达数量性状位点(expression quantitative trait locus, eQTL)是一类能够影响基因表达量的遗传位点(大部分都是单核苷酸多态性,SNP),具有一定的生物学意义。迄今为止最全的eQTL数据库是GTEx(https://www.gtexportal.org/home/),如今已更新到第八版了。
首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个数量性状,其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点,而eQTL就是控制数量性状表达位点,即能控制数量性状基因(如身高基因)表达水平高低的那些基因的位点。 数量性状基因座:控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用DNA分子标记技术对这些区域进行定位,与连续变...
使用现代基因型和表达阵列,一个典型的 qtl 分析可能涉及数百万个 SNPs 和数万个基因,使计算和多重测试成为关键的挑战。 即使是局部(顺式)的限制注意力的基因水平位点分析,也可能涉及数千万个基因-snp 对。 我们在 eQTL 分析方面的初步工作涉及纯合子群体中关联统计的快...
eQTL、共定位、pQTL、SMR、mQTL(甲基化)大数据联合分析思路 MR可以做临床方向，也可以做基础方向，如果你不单单为了发文章，还要考虑如何与自己申请课题、研究生开题结合起来的话，就是可以利用各类QTL数据进行挖掘，可以做纯的数据挖掘，也可以补上基础实验，可以根据自己的实际情况出发。具体思路可以参考这篇文章：作者...
QTL是数量性状位点,比如身高是一个数量性状,其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点,而eQTL就是控制数量性状表达位点,即能控制数量性状基因(如身高基因)表达水平高低的那些基因的位点。 都是位点,一个是常规数量性状,如身高;另一个就是基因表达性状,如Sox10基因的表达;都是在找一些与其具有强烈相关性的(snp)...