默认形状是圆形,我们可以通过shape参数指定图形的形状,该参数接受单个或四个可能的值:如果有四个值,设置的形状会和颜色一样分配到不同区间;如果是单个值,所有点都使用同一个形状。 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 ##shape为一个值EnhancedVolcano(res,lab=rownames(res),x='log2FoldChange'...
默认的配色方案可能不符合每个人的口味。在这里，我们使得只有通过log2FC和P值阈值的变量是红色的，其他的都是黑色的。我们还调整“alpha”的值，它控制打印点的透明度：1=100%不透明；0=100%透明。也可以绘制不同的点作为不同的形状。默认形状是圆。用户可以通过“shape”参数指定自己的形状编码，该...
小郭叨叨叨:本文档主要介绍EnhancedVolcano包及参数说明。作者 Kevin Blighe,R包信息参见Publication-ready volcano plot...
1. 使用包绘制火山图 1.1 基本用法 1.2 其他参数 1.3 斜体标签并在其一侧翻转火山 1.4 自定义方案 1.5 圈出/突出某些变量(此功能最适合仅对 1 或 2 ...
为了快速入门及有效展示,我们参考EnhancedVolcano的官方解说,之后会对部分参数解说,调整参数画出长在自己审美点的火山图。(因为R包EnhancedVolcano是更新的,如果参数有变,请参照报错提示修改代码) library(EnhancedVolcano)library(airway)library(magrittr)data('airway')airway$dex%<>%relevel('untrt') ...
也可以绘制不同的点作为不同的形状。默认形状是圆。用户可以通过“shape”参数指定自己的形状编码,该参数接受单个或四个可能的值:如果是四个值,则这些值映射到同样由颜色指定的标准名称;如果只有一个值,则所有点都将使用该值进行变化。 更多形状信息见ggplot2 Quick Reference: shape ...