PCR 后,核酸序列与重亚硫酸盐转化的 序列一致,使得 EM-seq 与现有分析流程(如 Bismark 和 bwa-meth)相兼容。 酶法的高效转化 指标 末甲基化 Lambda DNA CpG 甲基化 pUC19 DNA 预期转化效率 ≥99.5% ≥99.5% 实测转化效率 99.77% 99.57% 预期CpG 甲基化水平 约0.5% 95-98% 实测CpG 甲基化水平 0.22228%...
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这类方法包括重亚硫酸盐测序法、TAPS(TET-assisted pyridine borane sequencing)和酶法甲基化测序法(EM-seq)。TAPS和EM-seq是近期开发的,因此传统的单细胞甲基化分析是基于重亚硫酸盐的转化。使用重亚硫酸盐转化的方法被认为是分析DNA甲基化的金标准。由于其转化效率高(>99%)、重复性好、易于通过商业试剂盒获得,...
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PCR 后,核酸序列与重亚硫酸盐转化的 序列一致,使得 EM-seq 与现有分析流程(如 Bismark 和 bwa-meth)相兼容。 酶法的高效转化 指标 末甲基化 Lambda DNA CpG 甲基化 pUC19 DNA 预期转化效率 ≥99.5% ≥99.5% 实测转化效率 99.77% 99.57% 预期CpG 甲基化水平 约0.5% 95-98% 实测CpG 甲基化水平 0.22228%...
这类方法包括重亚硫酸盐测序法、TAPS(TET-assisted pyridine borane sequencing)和酶法甲基化测序法(EM-seq)。TAPS和EM-seq是近期开发的,因此传统的单细胞甲基化分析是基于重亚硫酸盐的转化。使用重亚硫酸盐转化的方法被认为是分析DNA甲基化的金标准。由于其转化效率高(>99%)、重复性好、易于通过商业试剂盒获得,...
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