鱼类eDNA 宏条形码通常从过滤水样中进行。在淡水生态系统中,水生生物膜被用于捕获大型无脊椎动物的 eDNA。在这里,我们测试了水生生物膜在一个大湖中捕获鱼类 eDNA 的能力,因此,与传统的过滤水样的鱼类 eDNA 方法相比,我们的研究结果支持水生生物膜捕获鱼类eDNA 的能力。因此,利用生物膜可以从该基质有效地监测鱼类群落...
鱼类eDNA 宏条形码通常从过滤水样中进行。在淡水生态系统中,水生生物膜被用于捕获大型无脊椎动物的 eDNA。在这里,我们测试了水生生物膜在一个大湖中捕获鱼类 eDNA 的能力,因此,与传统的过滤水样的鱼类 eDNA 方法相比,我们的研究结果支持水生生物膜捕获鱼类eDNA 的能力。因此,利用生物膜可以从该基质有效地监测鱼类群落...
eDNA宏条形码技术也有自身的局限性,如下:1.DNA在周围环境中的留存时间,不同的生物体释放DNA到环境中的速率不同,同时DNA在不同环境中的降解速率也不同;2.eDNA在采样、提取和储存过程中易受污染;3.物种特异性DNA条形码的可用性取决于已有数据库的质量,在多数研究中,一些物种只能确定到科或属是因为数据库中比对到的...
环境DNA（eDNA）宏条形码技术是用于监测海洋鱼类多样性的最新和最有发展潜力的方法。目前常用的获取鱼类eDNA方式是采集水样后过滤，使水样中的鱼类eDNA截留在滤膜上。这种主动采样方式不仅需要使用专门的设备，而且也难以实现大量水样的过滤。最近提出的eDNA被动采集方法可以扩大采样规模，为海洋生物多样性的监测提供新的视角。
eDNA宏条码技术在动物和植物方面应用广泛,检测物种的丰富度和相对丰度,调查全球生物多样性。 ▼(1)检测物种丰富度:常规方法vs eDNA宏条码技术 环境DNA条形码可以通过针对不同物种,并克服传统取样的局限性,适用于各种环境。例如,对于许多不同的水生系统,使用eDNA metabarcoding检测的两栖动物物种的数量等于或大于使用常规方...
覆盖本地历史记录形态学物种的62.5%和71.05%；（3）高分辨率，eDNA显著区分不同区域的藻类多样性，抚仙湖北>滇池南>滇池中/北。本研究探究并验证eDNA 宏条形码技术监测湖泊真核浮游植物多样性的可行性，将促进eDNA宏条形码监测技术推广与应用。相关研究结果发表于《环境科学》2021年第42卷第2期。
高通量测序(HTS)现在平台可以对各种环境样本进行处理DNA(称为环境DNA”或“eDNA)快速测序。将HTS和我们把eDNA序列与分类学名相关的能力结合在一起被称为eDNA宏条形码技术(eDNA metabarcoding),它为许多生态系统的物种丰富性提供了一种强大的分子工具。本文回顾了eDNA宏条码技术在动植物丰富度调查中的应用,以及在使用中...
凌波微课·基因凌距离-讲师介绍赵泽龙,红皇后学术公众号创始人,长期从事海洋、近岸和水产养殖环境微生物群落研究,熟悉微生物群落多样性、宏条形码、宏基因组、宏病毒组等单一组学以及多组学联合研究技术,尤其擅长环境样品的微生物生态学、抗生素耐药性以及非模式动物的共生菌群相关研究。2017年以来,研究成果以(共同)一作...
摘要 本发明公开了一种适用于eDNA宏条形码技术物种多样性分析的环境DNA提取试剂盒,裂解介质为纯锆珠,裂解液包括100‑200mM异硫氰酸胍、100‑300mM磷酸氢二钠,溶剂为水;除杂液的组分包括200‑400mM乙酸铵、30‑100mM十二水硫酸铵铝;结合液包含2‑10M盐酸胍;核酸吸附柱为硅胶膜吸附柱,洗涤液I为pH7.5的...
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