在用ecTag研究活细胞分裂的ecDNA的过程中,作者发现ecDNA在大多数的细胞中倾向于聚集在一起形成明亮的点状聚集的 “hubs”结构。进一步的研究发现这种hub状的结构中可以募集RNA polymerase 2,从而促进ecDNA上的基因的转录。研究发现,当细胞内的ecDNA hubs结构越多,越大ecDNA上的基因的转录活性就越高。因此,发现了细胞...
BRD4 结合的PVT1启动子与MYC异位融合并在 ecDNA 中复制,接受混杂的增强子输入以驱动MYC 的有效表达。此外,在外源性分子附加PVT1启动子后,足以通过ecDNAHub集以jq1敏感方式介导基因反式激活。通过 CRISPR 干扰系统沉默 ecDNA 增强子揭示了在不同 ecDNA ...
[3]ecDNA hubsdrive cooperative intermolecular oncogene expression.
在用ecTag研究活细胞分裂的ecDNA的过程中,作者发现ecDNA在大多数的细胞中倾向于聚集在一起形成明亮的点状聚集的 “hubs”结构。进一步的研究发现这种hub状的结构中可以募集RNA polymerase 2,从而促进ecDNA上的基因的转录。研究发现,当细胞内的ecDNA hubs结构越多,越大ecDNA上的基因的转录活性就越高。因此,发现了细胞...
当ecDNA在空间上同其他ecDNA聚集捆绑的时候,这种捆绑以某个ecDNA为核心(hub),其他ecDNA辅助,使转录原癌基因的可能性大大增加,例如,在结直肠癌细胞系中,BRD4捆绑的ecDNA促进MYC的表达,而JQ1可以驱散(disperse)这群ecDNA从而达到抑制ecDNA原癌基因转录的活性,BRD4结合的PVT1启动子与MYC融合以ecDNA的形式扩增,在其他ecDNA...
可以在Pan-Cancer Atlas hub(pancanatlas.xenahubs.net)找到。 长港项目 原始序列数据已存档于中国国家基因组数据中心/北京基因组研究所的基因组序列档案馆,存档号为HRA000873。 长港项目的处理临床注释和结构化基因组数据集可以在赵等【54】和changkang.hapyun.com/找到。 用于ecDNA载体基因建模、GCAP和AmpliconArchi...