BLAST中的E值(E-value)是什么意思? BLAST是指Basic Local Alignment Search Tool,是生物信息学中的一种序列比对算法,用于寻找蛋白质或核酸的相似序列。 下面是一个BLAST结果, 后面有两个值,一个是S值,一个E值。可以发现,结果是依据S值的高低来显示的。 S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度...
我们同时也可以等到E-value。 如果RR_{ED|c}^{obs} > 1, max(RR_{EU|c}, RR_{UD|c}) \geq E-Value = RR_{ED|C}^{obs} + \sqrt{RR_{ED|c}^{obs} \times (RR_{ED|c}^{obs} - 1)} 置信区间以及RR_{ED|c}^{obs} < 1的情况可以看下图。E值>=1。 例子(VanderWeele and Ding,...
未测量混杂因素(U)可能包含多个类别,使用k表示。E-value的计算基于所有未测量混杂因素与暴露之间的最大风险比和所有未测量混杂因素与结果之间的最大风险比。基本逻辑是利用不等式找到一个临界点,即最大值,来确定真实的风险比与观察到的风险比之间的关系。通过计算E-value,可以直观地了解未测量混杂效...
E值的计算公式为 E=K*m*n*(e-lambda*S)。 其中,K和lambda与数据库和算法有关,被视为常数;m代表目标序列的长度,n代表数据库的大小,S即上述提到的S值。通常,将E值设为小于10^-5被视为可接受的S值结果。具体而言,假设在相同的数据库下,当E值为0.001时,理论上会有1000条序列可能与...
对e-value值的by chance 进行解释 最近在使用blast进行序列检索的时候,有两个比较重要的评价标准,即Max score和e-value: score值很好理解,即根据不同的打分矩阵,对序列间的匹配程度进行打分,得分矩阵比如PAM和BLOSUM(氨基酸): e-value值的概念看起来就相对的比较模糊了,官方的定义是e-value:the number of hits ...
q-value的概念源自优化的FDR方法。它通过利用p值分布的特性生成调整后的p值列表,旨在控制所有显著检验结果中错误发现的数量。与p值相比,q值更倾向于减少假阳性,尤其是在进行大量假设检验时。在代谢组学实验中,假设存在4000个化合物,其中化合物A的p值为0.0101,q值为0.0172。p值表示假阳性的可能性...
E value:是期望值或E值,表示当在一个特定大小的数据库中搜索时,我们期望看到多少条序列能够获得同样的得分值,如E=1则可解释为在一个与刚才搜索数据库大小相近的数据库中随机搜索,我们期望还能找到1条与本序列得分相同或十分相近的序列。E值越接近0,表明该条目得分的显著性就越高,就越有可能与...
1 第一步我们首先需要知道Echarts设置y轴属性是yAxis,yAxis: { type: 'value', min: 0, max: 20,},设置最大值是20,最小值是0,如下图所示:2 第二步运行代码,可以看到折线图y轴最大值是20,最小值是0,如下图所示:3 第三步我们也可以设置最大值和最小值分别是数据的最大值和...
你定义的方法是否获取的到e这个参数,你直接在点击事件里应该有吧