去冗余工具通常基于序列的相似性或重复单元的相似性来去除冗余序列。然而,在同源四倍体中,每个染色体组都...
老师您好。hifiasm初步组装结果比预估大10%,也就是100M。我分别用purge_dup和nextpolish进行了分析。purge_dup直接移除了一个40M的contig。nextpolish把每条大的contig都删去了6-10M左右。两个分析的结果虽然各有优劣,但都还是不理想。可以先用purge_dup去冗余,然后再用nextpolish进行polish吗,或者相反的顺序。1 条评...