fslroi dti_tensor Dxx 0 1 fslroi dti_tensor Dyy 3 1 fslroi dti_tensor Dzz 5 1 用上面三条命令就提取出了我们需要的X,Y,Z方向的弥散率文件。 不是1,4,6吗?对,但FSL的下标是从0开始的。 接下来就简单了,弄上ROI,提取需要的值,然后对应带入计算公式中,就分分钟得到DTI-ALPS指标啦。 哦,对了...
Bland-Altman图和散点图展示了使用DSI Studio流程和FSL流程分别分析的15名参与者ALPS指数在每对扫描仪之间的ICCc结果(图3、图4、图5和图6)。成对ICCc均具有显著性(P<0.001):Philips-GE为0.91(95%CI [0.74;0.97])(DSI studio流程)和0.84(95%CI [0.58;0.94])(FSL流程),Philips-Siemens_Prisma为0.95(95%CI...
Bland-Altman图和散点图说明了15名参与者的ALPS指数的每对扫描仪之间的ICCc结果,分别使用DSI Studio管道和FSL管道进行分析(Fig. 3,Fig. 4,Fig. 5和Fig. 6)。成对ICCc均显著(P<0.001):Philips-GE为0.91(95%CI[0.74;0.97])(DS...
Bland-Altman图和散点图说明了15名参与者的ALPS指数的每对扫描仪之间的ICCc结果,分别使用DSI Studio管道和FSL管道进行分析(Fig. 3,Fig. 4,Fig. 5和Fig. 6)。成对ICCc均显著(P<0.001):Philips-GE为0.91(95%CI[0.74;0.97])(DSI Studio管道)和0.84(95%CI[0.58;0.94])(FSL管道);Philips-Siemens_Prisma为0....
21、进一步地,所述在侧脑室最上层平面的双侧上纵束、双侧上放射冠区绘制感兴趣区域具体为基于fsleyes在侧脑室最上层平面的双侧上纵束、双侧上放射冠区绘制感兴趣区域,保存绘制成功的感兴趣区域及对应参数,制作完成儿童类淋巴系统脑图谱。 22、进一步地,绘制的感兴趣区域包括位于投射纤维区的感兴趣区域,以及位于联络纤维区...
Two pipelines by using DSI studio and FSL software were developed for data processing and ALPS index calculation. The ALPS index was obtained by the average of bilateral ALPS index and was used for testing the cross-vendor, inter-rater and test-retest reliability by using R studio software. ...
或者如果熟悉FSL的命令的话,就是要给dtifit这个命令添加一个参数--save_tensor 这样一来,就会生成一个有6个Volume的4D文件,名字叫做dti fit_tensor.nii.gz,这个文件里面第1个Volume对应的就是Dxx,第4个Volume对应的是Dyy,第6个Volume就是Dzz。 大家可以用自己熟悉的工具把这个4D文件转成6个单独的3D Volume文件...
ALPS指数分别用于DSI Studio和FSL管道的可靠性和可重复性验证。 Statistical analysis 扫描仪间再现性:通过使用一致性类间相关系数(ICC)来评估四台扫描仪之间ALPS指数的扫描仪间可再现性。它使用了一个具有单一度量和一致性形式的双向随机效应模型,记为ICCc,计算如下: ...