DSSp是蛋白质结构中氨基酸残基二级结构图像分类的标准化算法,由WolfgangKabsch和ChrisSander设计。DSSP数据库是由该算法生成的存储蛋白质二级结构分类数据的数据库,包括PDB数据库(蛋白质数据库)中的所有条目。定义蛋白质的二级结构这个名称是作者在他的原始论文中提到的,作为实现该算法的Pascal语言程序的名称。DSSP数据库的...
最后使用dssp的指标进行画图,并且在图中标注,做到可视化的功能。 代码语言:javascript 复制 # 解析PDB文件 p=PDBParser()structure=p.get_structure("protein_name","/home/01.pdb")# 使用DSSP分析二级结构 model=structure[0]dssp=DSSP(model,"/home/01.pdb")# 提取阿尔法螺旋和贝塔折叠的片段 helices=[resfor...
DSSP 释义 abbr. deep submergence system program 深潜系统(研制)规划;digital statistical signal processing 数字统计信号处理;Division of Student Support and Special Programs 学生资助与特殊计划处 大小写变形:dssp
DSSP 什么是 DSSP 定义 数字传感器信号处理器。 Find a term alphabetically: 相关信息
DSSP(Dictionary of Secondary Structure of Protein)是用于对蛋白质结构中的氨基酸残基进行二级结构构像分类的标准化算法,由Wolfgang Kabsch和Chris Sander设计。它的算法建立在经典规范定义的氢键探测的基础上,是至今应用最广泛的二级结构定义系统。 使用GROMACS进行分子动力学模拟后,得到的轨迹可通过gmx do_dssp命令,调用...
DSSP，全称为 "Developmental Sport Skill Program"，是一个专用于描述发展性运动技能训练计划的英语缩写。这个缩写在运动领域中颇为常见，表示对运动员技能成长过程中的系统培养和提升。中文翻译为"发展性运动技能计划"，其拼音为fā zhǎn xìng yùn dòng jì néng jì huà。根据统计，DSSP在英语中...
DSSP,全称为"Define Secondary Structure of Proteins", 是由Wolfgang Kabsch和Chris Sander设计的一种标准算法，专门用于对蛋白质结构中氨基酸残基进行二级结构分类。其成果是一个名为"DSSP"的数据库，囊括了所有来自PDB(Protein Data Bank)的条目。这个数据库的英文全称是"...
gmx do_dssp -s test.tpr -f test.xtc -o test.xpm -sc test_sc.xvg test.xpm文件就是蛋白质二级结构图了,test_sc.xvg则是蛋白质二级结构百分比含量随时间变化的数据文件。 得到的xpm文件可以通过gmx的xpm2ps命令转换成ps或者eps文件再打开,诸多教程也是采用的这种方法。个人认为Jerkwin老师的xpm2all.bsh脚...
DSSP是"Digital Shape Sampling and Processing"的缩写，直译为“数字形状采样与处理”。这个术语主要用于计算机科学和软件开发领域，表示对数字形状进行采集和处理的全过程。在技术文献和在线交流中，DSSP的使用频率相当高，据统计，其流行度达到了15619次，表明其在相关行业中有广泛的应用。DSSP的中文拼音是...