The authors' reply: We thank Drs Artis and Gale for their careful review1 of our study on the dyssynchrony, scar and creatinine (DSC) index as a predictor of outcome after cardiac resynchronisation therapy (CRT).2 We shall deal with each point in turn. We agree that atrial fibrillation ...
回顾: GWASLab:连锁不平衡分数回归 LD score regression -LDSC GWASLab:通过Bivariate LD Score regression估计遗传相关性 genetic correlation GWASLab:基于功能分类分割遗传力 – 分层LD分数回归 Stratified LD score regression GWASLab:使用GWAS数据进行组织细胞特异性分析 - LDSC-SEG 使用LDSC计算单变量LD分数 单变...
LDSC是一个用python语言编写的程序,可以使用GWAS的summary结果,计算遗传力,遗传相关以及LD 得分,功能强大,应用广泛。 ldsc is a command line tool for estimating heritability and genetic correlation from GWAS summary statistics. ldsc also computes LD Scores. 官网地址: https://github.com/bulik/ldsc 1. ...
calculator volume calculator volume of a cylinder calculator z score calculator variance calculator more physics calculators power calculator voltage drop calculator chemistry calculators molarity calculator commerce class 11 commerce syllabus class 11 accountancy syllabus class 11 business studies syllabus class ...
Short tutorials describing the four basic functions ofldsc(estimating LD Scores, h2 and partitioned h2, genetic correlation, the LD Score regression intercept) can be found in the wiki. If you would like to run the tests, please see the wiki. ...
通过LD score regression,我们可以通过研究检验统计量与连锁不平衡(linkage disequilibrium)之间的关系来定量分析每部分的影响,即对干扰因素平均效应的估计值进行计算 LD Score的计算原理是什么? GWAS检验中,对一个SNP效应量的估计通常也会包含与该SNP成LD的其他SNP的效应,也就是说一个与其他SNP呈现高LD的SNP,通常也...
LDSC本质是一个线性回归,其输入数据为GWAS的分析结果,回归的自变量为SNP位点的LD score值,因变量是该算法的核心,自定义的一个符合卡方分布的统计量,通过线性回归拟合LD score和卡方统计量的关系,从而判断GWAS分析结果中是否存在混淆因素。 首先来看下自变量LD score, 对于一个SNP位点,其LD score定义该位点与其邻近位...
第一步我们得到了LD score值,进行LDSC分析,我们还需要GWAS分析结果。该软件制定了一种后缀为sumstats的格式,用来存储GWAS分析结果,要求有以下5列 SNP N Z P A1 A2 SNP表示SNP ID, 比如rs号;N表示样本个数;Z表示SNP对表型的效应值,beta, OR, z-score等等;P表示pvalue;A1表示突变的Allele,A2表示参照的Allel...
Imputation 质量与 LD Score 相关,若质量较差则会导致统计值较低。因此,我们通常根据 INFO > 0.9 进行过滤。本教程的 scz 和 bip 示例数据都包含 INFO 列,munge _ sumstats.py脚本会自动根据这一列的值进行过滤。若 GWAS 结果中没有 INFO 列,我们建议根据 HapMap3 snplist 进行过滤(用--merge或--merge-al...
DSC Regional Ranking (South America)Ranking details Team Descuydado Aucas Esports did not earn any rating points DSC Statson 19 二月 Not enough data to compile statistics for the Descuydado Aucas Esports Descuydado Aucas Esports Upcoming matches时间SGT 没有赛事 往期赛事 1 八月2023 DSC ...