结果表明,Smart-seq2的敏感度最高(中位数9,138/cell),Drop-seq和MARS-seq的敏感度最低,中位数分别为4,811/cell 和 4,763/cell(下图)。 还没看原文,测序深度设定多少 image 为了评估在多个细胞中检测到的基因总数差异,对每种方法将65个细胞的reads合在一起分析,结果发现19000个基因 for CEL-Seq2/C1, 1...
Enard及其同事发现,Drop-seq在单个细胞中检测的基因数还不到Smart-seq/C1、CEL-seq和SCRB-seq的一半。不过,在统计学水平上研究差异性表达的时候,高通量Drop-seq和SCRB-seq是最划算的。哈佛医学院Steve McCarroll实验室去年下半年根据用户反馈,在自己网站上公布了3.1版的Drop-seq(mccarrolllab.com/dropseq)。 参与...
High-throughput single-cell labeling (Hi-SCL) for RNA-Seq using drop-based microfluidics. PLoS One. 2015;10:e0116328.Rotem, A.; Ram, O.; Shoresh... A Rotem,O Ram,N Shoresh,... - 《Plos One》 被引量: 36发表: 2015年 Supplementary Material 2 High-throughput Single-Cell Labeling (...
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