dglke_train --dataset DRKG --data_files DRKG_train.tsv DRKG_valid.tsv DRKG_test.tsv --format raw_udd_hrt --model_name TransE_l2 --batch_size 2048 \ --neg_sample_size 256 --hidden_dim 400 --gamma 12.0 --lr 0.1 --max_step 100000 --log_interval 1000 --batch_size_eval 16 -adv...
DRKG是一个综合型生物医药知识图谱(图1),涉及人类基因、化合物、生物过程、药物副作用、疾病和症状六个方面。DRKG从六个公开的大型医药数据库和2200万篇医学文献中挖掘数据,并进行整理和规范化。DRKG知识图谱包含实体数97238个,分为13种实体类型;三元组数目5874261个,分为107种关系类型。 图1 DRKG知识图谱示意图,...
dglke_train --dataset DRKG --data_files DRKG_train.tsv DRKG_valid.tsv DRKG_test.tsv --format raw_udd_hrt --model_name TransE_l2 --batch_size 2048 \ --neg_sample_size 256 --hidden_dim 400 --gamma 12.0 --lr 0.1 --max_step 100000 --log_interval 1000 --batch_size_eval 16 -adv...
1.1 首先下载:程序软件压缩包 “wgethttps://dgl-data.s3-us-west-2.amazonaws.com/dataset/DRKG/drkg.tar.gz”。包里有四部分数据:drkg.tsv是原始的drkg文件,包含了(h,r,t)三维信息;embed:目录中包含了采用原始数据预训练GNN方法的分子SMILES;entity2src.tsv原始数据的实体图数据;relation_glossary.tsv,关系...
商标名称 DRKG 国际分类 第03类-日化用品 商标状态 商标注册申请 申请/注册号 57793531 申请日期 2021-07-18 申请人名称(中文) 刘三英 申请人名称(英文) - 申请人地址(中文) 河南省驻马店市上蔡县西洪乡关帝村二组 申请人地址(英文) - 初审公告期号 - 初审公告日期 2021-11-06 注册公告期号 - 注册公告日...
全称:DRKG。 公司介绍 公司成立于1991年,主营业务是投资教育与互联网创意产业,IT服务,健康与医疗等新兴与高科技产业。以软件技术为核心,提供行业解决方案、产品工程解决方案以及相关产品、平台及服务。 展开 信息为全网搜索整合加工而来,可能并不精确,仅供参考。
Knowledge Graph Embedding Based Analysis of DRKG Drug Repurposing Using Pretrained Model for COVID-19 DRKG with DGL Additional Information for DrugBank Licence Cite Drug Repurposing Knowledge Graph (DRKG) Drug Repurposing Knowledge Graph (DRKG) is a comprehensive biological knowledge graph relating genes,...
作者您好,请问您是用neo4j的哪个版本dbms生成的dump文件,我用4.2.3导入时显示Not a valid Neo4j archive: graph-dbms-drkg.dump 2023-12-28· 天津 回复喜欢 渐行渐凉渐忧 我想问下博主,drkg数据集中原始 drkg中的Gene::328483 这个328483是gene的什么编号呢? 2023-09-08· 河南 回复喜欢 ...
[ 摘要 ]最近,来自亚马逊上海 AI 实验室、亚马逊 AI 北美、明尼苏达大学、俄亥俄州立大学、湖南大学等机构的团队,正式开源了大规模药物重定位知识图谱 DRKG和一套完整的用于进行药物重定位研究的机器学习工具,助力新冠及其他疾病的药物重定...
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